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使用GDC API查看和下载TCGA的数据

API是应用程序编程接口,很多的网站都有对应的API,方便程序抓取数据,比如NCBI, EBI, KEGG等等,GDC也有对应的API, 可以方便的查询和下载TCGA的数据,API的网址如下 https...,可以实现特定数据集的访问和下载,GDC API的base url如下 https://api.gdc.cancer.gov/ https://api.gdc.cancer.gov/...endpoint是内置的指令,支持的指令如下所示 ? 从功能上可以划分为查询,下载,提交数据三大块,常用的的功能包括查询和下载 1....可以看到API返回的信息中包含了网页上提供的基本信息。在实际使用中,更多的是按照某种条件进行检索,相关的参数很多,这里就不展开了。 2....https://docs.gdc.cancer.gov/API/Users_Guide/Getting_Started/ 通过熟练使用API,可以实现程序自动化的下载TCGA数据,有很多TCGA数据下载的

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    机器学习数据集的获取和测试集的构建方法

    第二篇,会介绍下如何获取数据集和构建测试集的方法。前者,对于机器学习来说,数据集的好坏对模型性能有很大的影响。而后者,主要是避免两个偏差--数据透视偏差和采样偏差。 ---- 2....获取数据 2.1 常用数据集 在我们学习机器学习的时候,最好使用真实数据,即符合真实场景的数据集,而不是人工数据集,采用这种人工数据集在实际应用中会让系统表现很糟糕,因为人工数据集一般都和真实场景下的数据有较大的差异...网页中也有一个搜索框来帮助用户寻找想要的数据集,还有所有数据集的描述和使用示例,这些数据集信息丰富且易于使用!...CelebA:人脸数据集,包含大约 20w 张图片,总共 10177个不同的人,以及每张图片都有 5 个位置标注点,40 个属性信息 2.2 准备开发环境 在找到数据集,并下载后,我们就需要开始准备开发环境...2.3 创建测试集 在下载数据后,首先要做的是创建测试集,这是在分析数据前先排除测试集的数据,不会引入测试数据的规律,从而影响算法的选择,保证采用测试集进行测试的结果是客观可信的,而不会出现数据透视偏差的问题

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    Python气象数据处理与可视化

    CDS平台,即气候数据存储(Climate Data Store),是一个提供气候和气象数据的平台,它允许用户访问和下载各种气候数据集,包括ERA5数据。...CDS平台提供了强大的数据管理功能,包括数据收集、存储、整理、清洗和分类等。通过构建高效的数据处理机制,CDS确保了数据的准确性和一致性,为后续的数据分析和算法迭代提供了可靠的基础。...关于利用cdsapi+IDM批量下载ERA5数据的教程帖子非常多,主要步骤是:1)注册/登陆后打开CDS上的个人主页,找到API,复制url和key2)获取API Token后在用户目录下配置.cdsapirc...文件3)下载安装cdsapi第三方库4)下载安装IDM-Internet Download Manager,IDMan.exe的路径要记住,后面写代码要用5)获取所需要数据的API request code...shapefileShapefile 是一种广泛使用的地理空间数据格式,主要用于存储地理信息系统的(GIS)矢量数据,如点、线、多边形等几何对象及其属性信息。

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    WenetSpeech数据集的处理和使用

    WenetSpeech数据集 10000+小时的普通话语音数据集,使用地址:PPASR WenetSpeech数据集 包含了10000+小时的普通话语音数据集,所有数据均来自 YouTube 和 Podcast...为了提高语料库的质量,WenetSpeech使用了一种新颖的端到端标签错误检测方法来进一步验证和过滤数据。...下载并解压WenetSpeech数据集,在官网 填写表单之后,会收到邮件,执行邮件上面的三个命令就可以下载并解压数据集了,注意这要500G的磁盘空间。...然后制作数据集,下载原始的数据是没有裁剪的,我们需要根据JSON标注文件裁剪并标注音频文件。...--wenetspeech_json参数是指定WenetSpeech数据集的标注文件路径,具体根据读者下载的地址设置。

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    常见公开人脸数据集的获取和制作自定义人脸数据集

    前言开发人脸识别系统,人脸数据集是必须的。所以在我们开发这套人脸识别系统的准备工作就是获取人脸数据集。本章将从公开的数据集到自制人脸数据集介绍,为我们之后开发人脸识别系统做好准备。...CelebA人脸数据集官方提供的下载地址:链接:https://pan.baidu.com/s/1zw0KA1iYW41Oo1xZRuHkKQ 密码:zu3w该数据集下载后有3个文件夹,Anno文件夹是存放标注文件的...该项目可以分为两个阶段,第一阶段是人脸图片的获取和简单的清洗,第二阶段是人脸图片的高级清洗和标注人脸信息。人脸信息的标注和清洗使用到了百度的人脸识别服务。...第一阶段爬取人脸图片的核心思路就是获取中国明星的名字,然后使用明星的名字作为图片搜索的关键字进行获取图片,然后删除下载过程损坏的图片和没有包含人脸的图片,或者过多人脸的图片(我们只保存一张图片只包含一张人脸的图片...接着就删除URL文件中,一些删除的文件对应的URL。最好就使用百度的人脸检测服务标注清理后的图片,最终得到一个人脸数据集。

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    数据访问函数库的使用方法(二)—— 获取记录集和使用事务的方法

    使用SQL语句来获取记录集的方法 string sql = "select col1,col2,col3  from TableName where ";             //获取DataTable...可以通过字段名称来获取             DataRow dr = dal.RunSqlDataRow(sql);             //只获取第一条记录的第一个字段的值             .../// 使用 DataTable 可以很方便的实现“通用”性,可以直接和许多控件绑定。             /// 使用 string[] 保存一条记录的数据,可以更轻量快捷的提取和保存数据。...适用于字段比较少的情况。             /// 如果字段比较多可以使用  dal.RunSqlDataRow(sql); 的方式。             .../// 优点:在函数内部自动处理连接的打开和关闭的问题。             /// sql语句出现错误的时候,会在/log/里面建立一个文本文件,记录出错的信息。

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    Dataset之COCO数据集:COCO数据集的简介、下载、使用方法之详细攻略

    Dataset之COCO数据集:COCO数据集的简介、安装、使用方法之详细攻略 COCO数据集的简介 MS COCO的全称是Microsoft Common Objects in Context...COCO数据集是一个大型的、丰富的物体检测,分割和字幕数据集。...COCO数据集有91类,虽然比ImageNet和SUN类别少,但是每一类的图像多,这有利于获得更多的每类中位于某种特定场景的能力,对比PASCAL VOC,其有更多类和图像。...COCO数据集的下载 官网地址:http://cocodataset.org/#download 1、2014年数据集的下载 train2014:http://images.cocodataset.org...zips/test2017.zip test2017 info:http://images.cocodataset.org/annotations/image_info_test2017.zip COCO数据集的使用方法

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    【Groovy】Xml 反序列化 ( 使用 XmlParser 解析 Xml 文件 | 获取 Xml 文件中的节点和属性 | 获取 Xml 文件中的节点属性 )

    文章目录 一、创建 XmlParser 解析器 二、获取 Xml 文件中的节点 三、获取 Xml 文件中的节点属性 四、完整代码示例 一、创建 XmlParser 解析器 ---- 创建 XmlParser...Xml 文件中的节点 ---- 使用 xmlParser.name 代码 , 可以获取 Xml 文件中的 节点 , 节点位于根节点下, 可以直接获取 , 由于相同名称的节点可以定义多个... 节点, 获取的是数组 // 也是获取第 0 个元素 println xmlParser.team[0].member[0] 三、获取 Xml 文件中的节点属性 ---- XmlParser...获取的节点类型是 Node 类型对象 , 调用 Node 对象的 attributes() 方法 , 可获取 Xml 节点的属性 ; // 获取 name 节点 Node nameNode = xmlParser.name...[0] // 获取 Activity 节点的属性 , 这是一个 map 集合 println nameNode.attributes() 执行结果为 : [code:utf-8] 四、完整代码示例 --

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    最新 COCO数据集的下载、使用方法demo最新详细教程

    摘要 本文为您提供了COCO数据集的全面指南,涉及其下载、安装及使用方法。文章内容覆盖Python编程语言和机器学习框架,适用于所有级别的读者。...正文 COCO数据集概览 COCO(Common Objects in Context)数据集是计算机视觉研究领域广泛使用的一个大型图像数据集,特别适用于对象检测、分割和图像识别任务。...下载和设置COCO数据集 环境准备 首先,确保你的环境中安装了以下Python库: pip install numpy matplotlib pycocotools 下载数据集 COCO数据集可以从其官方网站下载...COCO数据集 使用Python和pycocotools库,可以轻松加载和使用数据集中的图像及其注释。...A2: 增强数据预处理步骤,使用高级的神经网络架构,以及进行细致的超参数调整。 小结 我们详细介绍了如何下载和使用COCO数据集,包括基础的数据处理和图像标注方法。

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    未使用的数据集和多数据集会影响运算不

    首先想知道多数据集和未使用的数据集影响运算不,我们需要先了解设计器是怎么运算的,皕杰报表的brt文件在服务端是由servlet解析的,其报表生成的运算顺序是:变量参数运算-->数据集取数及运算-->报表运算及扩展...,前面的步骤未走完,是不会往下进行运算的。无论报表里是否用到了这个数据集,报表工具都要先完成数据集的取数和运算再进行报表运算,因而,如果数据集发生卡滞,整个报表就不能运算了。...皕杰报表中影响数据集取数的因素主要包括,数据库的JDBC驱动不匹配,取数据的sql不正确或不够优化,数据量太大占用内存过多。...1、数据库的JDBC驱动是由数据库厂家配套的,不仅与数据库的版本相关,还与jdk的版本相关,JDBC驱动不匹配就不能从数据库正常取数了。...如皕杰报表6.0的运行环境是JDK1.8,如JDBC驱动不支持JDK1.8就不能正常取数。2、取数据的sql可放到数据库客户端上先行运行测试,以确保取数sql正确。

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    最新 CIFAR-10数据集的下载、使用方法demo详细教程

    最新 CIFAR-10数据集的下载、使用方法demo详细教程 摘要 在本篇博客中,我们将详细探讨CIFAR-10数据集的下载和使用方法,涵盖了Python编程语言的应用,TensorFlow和PyTorch...引言 亲爱的读者们,作为猫头虎博主,今天我将带领大家深入了解CIFAR-10数据集,这是机器学习领域中经常使用的一个基础图像识别数据集。...A1: 主要用于图像识别和计算机视觉的教学和研究。 Q2: 如何提高模型在CIFAR-10上的表现? A2: 可以通过调整模型架构、增加数据增强或使用更复杂的神经网络模型来实现。...小结 在本篇教程中,我们详细介绍了CIFAR-10数据集的下载及使用方法,并展示了如何在TensorFlow和PyTorch中应用这一数据集。...,CIFAR-10数据集仍将是图像处理和分类研究的重要资源。

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    近期问题汇总(五)

    最近,有老师用过CDS下载ERA5数据吗,我今天下载数据一直在排队中,以前从来没有遇到过排这么久的情况 欧洲中心转移服务器中,还需静待 7. 请问大家谁做过WRF的obsnuding吗?...请问python调用的 matplotlib.cm下的colormap 怎么下载其rgb呢 ? 在Python中,你可以使用matplotlib库的`cm`模块来获取colormap。...例如,要获取索引为0.5的颜色,你可以这样做: rgb = cmap(0.5) 这将返回一个RGBA元组,其中A(alpha)是透明度,R、G和B分别代表红色、绿色和蓝色的强度。...使用pycinrad或pycwr读取获得的雷达变量已经是xarray格式,就当普通的数据去索引即可 不知怎么用xarray可查看往期推文如何快速熟悉一个陌生的nc格式数据 10....想问一下大家降水的站点数据能在哪里找到 答案是ISD (Integrated Surface Dataset,全球地面观测数据集) 网址是 https://www.ncei.noaa.gov/access

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    大数据笔记(五):HDFS权限和Java的api使用

    HDFS权限和 Java的api使用 前言 博主语录:一文精讲一个知识点,多了你记不住,一句废话都没有 经典语录:别在生活里找你想要的,要去感受生活里发生的东西 一、HDFS的权限 1、启蒙案例 Permission...] 结论:默认hdfs依赖操作系统上的用户和组 二、hdfs中Java的api使用 windows idea eclips  叫什么?...//其实用户和程序读取的是文件这个级别~!并不知道有块的概念~!...// blk01: he // blk02: llo lanson 66231 in.seek(1048576); //计算向数据移动后,期望的是分治...,只读取自己关心(通过seek实现),同时,具备距离的概念(优先和本地的DN获取数据--框架的默认机制) System.out.println((char)in.readByte());

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    父类和子类对象的获取值的方式验证,通过父类属性的方式获取不到值,需要使用get方法

    父类和子类对象的获取值的方式验证,通过父类属性的方式获取不到值,需要使用get方法 静态属性通过类.属性的方式获取,对象获取使用get方法获取 package com.example.core.mydemo.java...channelName) { this.channelName = channelName; } /** * partnerName: //通过父类属性的方式获取不到值...,需要使用get方法 * channelName: //通过父类属性的方式获取不到值,需要使用get方法 * partnerName2:合作商名称 * channelName2...* channelName3:渠道商名称 //对象自身的属性值可以获取 * partnerName4:合作商名称 * channelName4:渠道商名称...* MAX=100 静态属性通过类.属性的方式获取,对象获取使用get方法获取 * @param args */ public static void main(String

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