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如何将一个数组分成不同的“mags”

“mags”是一个不常见的术语,可能是特定领域或特定系统中使用的缩写或术语。根据提供的信息,我无法确定“mags”的确切含义。请提供更多上下文或解释以便我能够更好地回答你的问题。

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内蒙古农大孙志宏教授证实超深度混合宏基因组测序能够对人类肠道微生物组中的低丰度物种进行基因组和功能表征

人类肠道微生物群中已经发现了大量微生物基因组,但由于目前大多数研究中使用的测序深度相对较浅,在个体水平上了解低丰度物种的作用仍具有挑战。为了提高基因组的组装性能,本研究采用了Illumina HiSeq与Pacbio混合、超深度宏基因组测序的方法,从12份粪便样品中重建了宏基因组组装基因组。该方法结合了第二代测序以及第三代测序,提高了肠道中低丰度微生物的测序覆盖率。我们共还原了44个Mb级别scaffolds以及4个完整的环状基因组 (CMAG),代表了对应物种下的首个环状基因组。此外,从所有样品中共组装出475个高质量的基因组,其中234个为未培养微生物的基因组,并且有24个不存在于任何一个公共数据库中。值得注意的是,有287个和77个基因组分别为每个个体的低丰度和超低丰度的肠道物种。同时,我们的研究结果揭示了个体特异性的基因组特征,包括微生物基因组生长速率、选择压力以及染色体可移动遗传元件的频率。最终,从宏基因组数据中鉴定出数千个染色体外的可移动遗传元件,包括5097个噬菌体和79个新的质粒基因组。总的来说,本研究方法为从个体水平上对人类肠道微生物群进行更加全面的基因组分析和功能表征迈出了重要的一步。

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