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「R」数据可视化15:倾斜

具体专用包比较好用一个函数就可以搞定,所以就只介绍最常见的方法使用ggplot2进行作图方法: 1)需要什么格式的数据 目前疫情地图实时更新,所以这次就正好用公开的疫情数据做一次倾斜。...因为2020年1月20日,钟南山院士在发布会上正式确定武汉肺炎病毒可以人传人,所以取了1月20日的确定感染人数的数据(截至24:00)和今天1月25日(截至16:27)的确定感染人数数据。...编辑:王诗翔 往期精彩: 「R」数据可视化14: 瀑布 「R」数据可视化13 : 相关性 「R」数据可视化12 : 生存曲线 「R」数据可视化11:PCA和PCoA 「R」数据可视化10:面积...「R」数据可视化9: 金字塔和偏差 「R」数据可视化8:棒棒 「R」数据可视化7 : 蜜蜂 「R」数据可视化6 : 曼哈顿 「R」数据可视化5 : 气泡 「R」数据可视化4 : 直方图/条形...「R」数据可视化3 : 热 「R」数据可视化2 : 箱形 「R」数据可视化1: 火山

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    数据可视化之下发实践

    作者:个推前端工程师 东风 随着互联网的快速发展,数据维度越来越广,呈现形式也越发丰富,具有多维度数据特点的相关业务实践都能通过可视化图表来展示,比如个推的下发,从时间和区域两个维度,可以即时、直观地展现个推数据下发的过程...一、下发的由来 个推下发主要用于呈现个推为APP提供推送服务时数据的下发过程,可以直观显示个推推送触达到的城市,有利于开发者对下发数据进行分析。...个推下发运用了迁徙的原理,再通过自主设计开发出的一套可视化展示图像。这一类型的可视化可以广泛应用于拥有地理位置信息和数据转移特征的数据展示。...两款技术栈的具体性能对比如下: [c5bb8be7371282d71c7f808433cafb50.png] 五、总结 随着数据维度的扩展和丰富,数据可视化的形态日渐丰富。...作为地理位置信息和数据转移特征的数据可视化图表,下发可以更直观地展现个推为APP提供推送服务时的下发量、下发区域等数据,对APP的行业分析以及战略调整有着指导性意义。

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    「R」数据可视化7 : 蜜蜂

    在生物信息领域我们常常使用R语言对数据可视化。在对数据可视化的时候,我们需要明确想要展示的信息,从而选择最为合适的突出该信息。本系列文章将介绍多种基于不同R包的作图方法,希望能够帮助到各位读者。...什么是蜜蜂 不知道蜜蜂的名字从何而来,我猜测可能是因为画这个的包叫做beeswarm?我们先来看看蜜蜂长什么样。 ?...看上去和我们之前的点很像,我们可以直观来比较一下beeswarm和ggplot中使用jitter及point(默认参数)绘制同一组关于乳腺癌数据: ?...从中可以发现,beeswarm很好的体现了数据的分布,更加清楚、直观。而后两者,难以快速获取信息,point图中点过于密集,jitter中分布过于散乱。这也是很多科学论文选择beeswarm的原因。...Note:没有安装相关R包的,先安装R包 1)需要什么格式的数据 本次使用的是beeswarm包中的breast数据。 ?

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    「R」数据可视化16:哑铃

    哑铃是一种很好的可视化方式,比如你想要表征不同指标的不同组的情况你可以用多个“哑铃”表示。另外,你想要表示某一组在外界刺激后的变化情况也可以用这种方式。 我们来看两个例子。...另外,现在有很多是多组学的数据,我们会统计志愿者的年龄,或者展示某些生理指标的范围等,所以我们也可以考虑第二个例子,用哑铃进行展示,这样可能会比图标看起来更加直观一些,也显得更加美观。...然后可以用AI添加一下图例哦 往期精彩: 「R」数据可视化15:倾斜 「R」数据可视化14: 瀑布 「R」数据可视化13 : 相关性 「R」数据可视化12 : 生存曲线 「R」数据可视化11:PCA...和PCoA 「R」数据可视化10:面积 「R」数据可视化9: 金字塔和偏差 「R」数据可视化8:棒棒 「R」数据可视化7 : 蜜蜂 「R」数据可视化6 : 曼哈顿 「R」数据可视化5 :...气泡 「R」数据可视化4 : 直方图/条形 「R」数据可视化3 : 热 「R」数据可视化2 : 箱形 「R」数据可视化1: 火山

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    「R」数据可视化1: 火山

    在生物领域我们常常使用R语言对数据可视化。在对数据可视化的时候,我们需要明确想要展示的信息,从而选择最为合适的突出该信息。本系列文章将介绍多种基于不同R包的作图方法,希望能够帮助到各位读者。...什么是火山 ? 火山,是形如火山喷发的一种图形展示方法,常被用于展示差异,比如差异基因、差异微生物等等。 上图就是一张典型的火山,描述了差异基因的情况。...火山要怎么画 (1) 需要什么格式的数据 从网上找了一个别人的RNA-seq数据 ,让我们一起来瞧瞧。 ?...(2) 如何使用ggpot2做火山 能够做火山的方法有很多,有一些RNA-seq分析的包中自带了画火山的函数。...然后我们来美化这张火山。 #加载包 library(ggplot2) library(ggrepel) #读取数据 Dat<-read.table('.

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    「R」数据可视化18:弧形

    其实,这几种展现网络关系的各自特点,下面我们来看一个非常有意思的例子,以展现弧形的优势(例子来源:data-to-viz网站[1])。 首先来介绍一下绘图的数据。...而这次例子的数据就是收集了许多文章和作者,通过不同的网络来展示作者之间的关联:如果两个作者出现在同一篇文章里,那么就会用线将他们连接起来。 我们先来看一下最基础的网络的效果。...怎么做弧形 1)需要什么格式的数据 我们还是用上面例子中的数据,代码来源还是参考上面提到的data-to-viz网站[2]。...具体需要两部分的数据,一部分是具体的贡献情况connect表,另一个是各个作者的共现数目coauth表。...那么我们来调整一下数据: # 鉴定社区 com <- walktrap.community(mygraph) #重新整理数据 coauth % mutate( grp =

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    「R」数据可视化14: 瀑布

    什么是瀑布 Waterfall Plot Wiki上介绍的瀑布分为两种,一类是2D形式,另一类是3D形式。我们简单介绍一下2D形式的瀑布。该类瀑布用于描述一系列中间正值或负值如何影响初始值。...怎么做瀑布 本次作图我们使用一个叫做GenVisR的R包。该包除了提供瀑布还提供了多种其他形式较为复杂的、用于展现多个样本突变情况的数据(见下图)。...今天我们要使用该包提供的一个叫做brcaMAF的数据表,通过名字也可以看出这是乳腺癌的数据,该数据包含50个样本,来源于TCGA,格式为MAF格式。...该文件格式标准由TCGA制定,包含了一些关于突变的常见信息,进一步的具体信息详见MAF格式介绍 1)需要什么格式的数据 我们首先来看一下brcaMAF数据的情况,可以看到该数据包括了55列信息,如Hugo_Symbol...具体地分为三类情况,瀑布地功能提供了三种数据格式的选择:1.MAF必须包括列名为"Tumor_Sample_Barcode","Hugo_Symbol","Variant_Classification

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    「R」数据可视化3 : 热

    在生物信息领域我们常常使用R语言对数据可视化。在对数据可视化的时候,我们需要明确想要展示的信息,从而选择最为合适的突出该信息。本系列文章将介绍多种基于不同R包的作图方法,希望能够帮助到各位读者。...什么是热(Heatmap) 热是一个以颜色变化来显示数据的矩阵。Toussaint Loua在1873年就曾使用过热来绘制对巴黎各区的社会学统计。 ?...相关性的热: 格子中的数值代表相关性系数 怎么做热Heatmap 1)需要什么格式的数据 有很多的软件都可以做heatmap。我们要介绍的当然是R,R默认中提供了heatmap函数。...dataframe与matrix 2)如何做 本节用一个不是那么生物的数据集来展示一下如何做热。 data("attitude") Ca <- cor(attitude) ?...黑色的线之前我们已经提到过是对数据进行了聚类。 然后我们对进行一些修改,红色太扎眼换个颜色,把一些不需要的功能去掉。比如聚类比如这些蓝色的线。

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    数据可视化之风向

    很多人都见过风向,直观形象,也是地图数据和现实数据可视化上很好的结合。...对我而言,1简单易懂,可以快速掌握风向的实现;2是实时的全球风向数据,而且是二进制格式,是大数据传输的一个方案;3则采用WebGL实时渲染,算是大数据渲染的一个方案,所以各有千秋。...如上图,是一个真实的风向数据。...可能不同平台的风向数据有一定差别,但都大同小异。 向量场和数据格式,直觉上,我们可以知道,就是把这些向量拟合成平滑线,可以形成如下一个真实的风向。...一个风向,你当然希望能在地图上实时的看到具体一个区域的风向和全球的整体效果,这就需要解决数据的高效传输。

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    「R」数据可视化8:棒棒

    棒棒糖,“望文生义”,就是长得像棒棒糖的。听起来就很可爱是不是?今天就让我们一起欣赏一下棒棒糖。 什么是棒棒糖 首先让我们来看几张棒棒糖。...可以发现实际上就是一根柱子加上一个圆,其实类似传统的柱状。但是它可以给我们更多的信息,因为圆和下面的棒子可以代表同一组数据,也可以代表两组数据。...from tableau website 怎么做棒棒糖 1)需要什么格式的数据我们用R中自带的一个数据——mtcars。...该数据来源于1974年Motor Trend杂志,是关于不同车型的设计和性能的数据统计: [, 1] mpg Miles/(US) gallon [, 2] cyl Number of cylinders...稍微对数据进行一点处理: # Load data data("mtcars") dfm <- mtcars # 转为factor类型的数据 dfm$cyl <- as.factor(dfm$cyl) #

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    「R」数据可视化5 : 气泡

    本文作者蒋刘一琦 在生物信息领域我们常常使用R语言对数据可视化。在对数据可视化的时候,我们需要明确想要展示的信息,从而选择最为合适的突出该信息。...什么是气泡 气泡(Bubble Plot)就是由一个个像气泡元素组成的。...从上述例子中可以发现用气泡我们能展示更多的数据信息。随着多组学研究的涌现,我们急需在同一张图表来展现多维的数据,气泡就是一个不错的选择。...怎么做气泡 1)需要什么格式的数据 根据最终想要在气泡图上展示数据的维度以确定数据的格式。本次用一个来自于GOplo包的数据EC,该数据为RNA-seq的下游分析数据。...然后,我们来看一看用常见的包ggplot2应该如何做该。首先我们要对数据处理一下,剔除一些不必要的信息: circ2<-circ[!

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    「R」数据可视化20:弦

    是一种展示数据之间相互关系的图形。弦图中的数据点以圆的形式呈放射状排列,并用线条来展示数据之间的联系。在弦图中,我们可以通过颜色和线条的粗细来展现不同类型联系和强度。...通常来说,当数据点不是很多的时候,弦能很直观地展现出不同数据点之间的关系。但是当数据点过多的时候,可能弦看起来就有一些混乱了,不过具体是否采用这种,还是要看你想用去表达什么结论。...当然了多幅弦还能展现出不同组别或者不同时间点之间的差异,具体如何展现可以看我们今天的具体示例。 如何作弦 1)需要什么样的数据 今天找到了一个酷炫的弦图例子还是个动。...该用来展示1960年到2015年的全球移民情况。当然我们会画静态+动。我只是一个代码搬运工,参考了国外网友写的代码:原代码请点击这里[1]我们要使用的数据来自于“migest”这个包。...然后我们可以写一个循环生成多张然后制作成gif。我们可以根据时间点将数据切割。

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    「R」数据可视化10:面积

    什么是面积 面积是一种源于折线图但是改变了其展现方式的图形。具体地,它通过一定的区域面积来表示数据大小,利用不同的颜色或者线条来区别不同组的数据。...William Playfair,苏格兰工程师和政治经济学家,是图形化统计方法的创始人,是面积的发明人,除此之外他还发明了折线图、条形、饼等。...通过上述例子可以看出面积和折线图很相似,在很多时候两者可以相互替代,以丰富数据可视化的形式。...怎么做面积 1)需要什么格式的数据本次使用的是一个US economic time series的名叫economics的数据。我们选择其中的两列数据:psavert和uempmed。...数据格式 2)如何作图 library(ggplot2) library(lubridate) library(RColorBrewer) #psavert=personal savings rate

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    14个Seaborn数据可视化

    调查数据并从中提取信息和趋势的工具。 ? 绿色代表新的开始和成长,也意味着更新和丰富。 数据可视化数据挖掘中起着非常重要的作用。各种数据科学家花费了他们的时间通过可视化来探索数据。...因此,我希望本文能够为您提供关于所有可视化方法的架构。 目录 简介 了解你的数据 分布曲线 a. 直方图b. 联合c. 配对d. Rug 分布a. 条形b. 统计c. 箱型d....Facet Grid 回归 简介 Seaborn是一个基于matplotlib的Python数据可视化库。它提供了一个高级界面,以绘制曲线和信息统计图形。...11:‘年龄’与‘P-class’之间的swarm 矩阵图 这些是使用二维矩阵数据进行可视化的特殊类型的图形。由于矩阵数据的维数较大,很难对其进行分析和可视化。...我相信数据可视化增强了我们对数据解释的理解和潜力。它给我们提供了更令人满意的技能来表示数据,输入缺失值,识别异常值,检测异常,以及更多。 数据分析师就像警察一样,需要询问数据并通过它们得到信息。

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    「R」数据可视化6 : 曼哈顿

    本文作者蒋刘一琦 在生物信息领域我们常常使用R语言对数据可视化。在对数据可视化的时候,我们需要明确想要展示的信息,从而选择最为合适的突出该信息。...什么是曼哈顿 曼哈顿是一种散点图,通常用于显示具有大量数据点,许多非零振幅和更高振幅值分布的数据。该通常用于全基因组关联研究(GWAS)以显示重要的SNP(来源wiki)。 ?...好久没看过文章) 怎么做曼哈顿 用于做曼哈顿最常用的一个R包叫做qqman——an R package for creating Q-Q and manhattan plots。...1)需要什么格式的数据 qqman提供的数据例子很直接就叫做"gwasResults",数据格式如下: library(qqman) data("gwasResults") head(gwasResults...那么我们在前期处理数据的时候需要将这些数据标记出来,这个过程和之前火山图标记显著的基因很类似: don % # Compute chromosome size

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    数据可视化API之轨迹实现

    前言 数据可视化API(Web),是基于腾讯位置服务JavaScript API GL实现的专业地理空间数据可视化渲染引擎。...通过这套API,可以实现轨迹数据、坐标点数据、热力、迁徙、航线等空间数据可视化展现。...注册成为腾讯位置服务开发者,并进入控制台 -> key管理界面创建key; [46e7885db1b649b48ad6a0c08f8feb6a~tplv-k3u1fbpfcp-watermark.image] 2、数据可视化...API(以下简称可视化API),所提供的可视化效果是以图层的方式叠加在JavaScript API GL之上,图层中所显示的数据由实例化的对象统一管理。...v=1.exp&key=YOUR_KEY&libraries=visualization"> 轨迹实现 大家可通过参考手册 先了解下参数详情,以下是代码示例。 <!

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