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fNIRS在发育科学应用

:易激惹性独特地预测了学前儿童抑 对前语言期婴儿心理理论相关颞顶联合区近红外研究 fNIRS:3-8个月大婴儿面孔加工研究 眼动追踪与近红外结合:婴儿利他行为神经发育基础 fNIRS超扫描:亲子互动脑同步及其与情绪关系研究...这些信息可为发育理论提供信息,例如深入了解未成熟大脑功能组织、推断指导学习领域特殊性与领域一般性机制。发育研究最终目标是了解知识、表征能力如何随时间变化,以及变化如何发生。...尽管存在这些问题,fNIRS研究还是为发育科学做出了重要、无法替代贡献。本文首先概述fNIRS技术以及其如何在婴儿应用,然后回顾使用fNIRS得出主要发现,这些发现对领域做出了独特贡献。...需要牢记是,fNIRS研究一个目标是填补使用行为数据无法研究空缺,为发展理论提供更多信息。 4.1.大脑发育 充分了解发展大脑需要研究更多与年龄相关行为变化背后神经机制。...静息态功能连接变化(一种自组织过程)有助于解释发育中大脑整合、存储信息变化。 4.8.超扫描 超扫描是神经科学一种新范式,可以同时测量两个或多个被试大脑活动。

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DTI在早期脑发育研究应用

Neuron:联合皮层神经发育模式和对精神病学启发 神经发育视角看待数学学习 自闭症研究默认网络 青春期与人类大脑 JAMA Psychiatry:社区劣势与青少年神经认知和大脑结构关系...家庭收入与认知和大脑结构关系:美国儿童研究 脑网络核心节点发育 儿童早期大脑结构和功能发育影像学研究 Neuron:人类大脑早期发育 深度学习在婴儿大脑磁共振图像分析作用(上) Nature...在主要投射纤维,内囊和脑带蒂核心区域发育良好(图2a,b)。内囊前后肢比例表明前部较发达。然而,放射冠在胎儿大脑中并不清晰可见。...因此,利用DTI评估婴儿大脑发育与复杂认知功能相关细微个体差异能力有望提高我们对发育可塑性和神经认知阶段性发育理解。 近年来,人们用DTI方法研究了6个月大婴儿脑白质微观结构特征。...DTI利用从扩散加权图像得到对称正定张量场来表征脑组织水扩散剖面的椭圆形形状。 2. 各向异性分数和水扩散率可以从DTI得到,并可用于表征生命早期脑白质发育不同阶段。 3.

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    异常伤口愈合小鼠模型单核细胞对异位骨化调控

    异位骨化(Heterotopic ossification,HO)是指在非骨组织形成骨组织病理过程。...通常情况下,骨组织只存在于骨骼系统,但在异位骨化,骨组织可以在软组织、肌肉、关节囊等非骨组织形成。...CSF1R在我们淋巴细胞和粒细胞群也有表达。...−,Fcgr1+细胞 探究单核细胞和巨噬细胞簇内发育关系 使用Monocle算法对簇1、3、4和7进行了轨迹分析,根据单核细胞和巨噬细胞基因表达变化确定了三个分支点,并在伪时间绘制了这一点 星团叠加在单面伪时间图上...,发现星团1朝着伪时间开始方向坠落,而星团4、3和7则沿着剩余轨迹依次下降 结合芯片数据以及RnaSeq数据分析,验证单核细胞和巨噬细胞对于HO形成是重要 左图:来自烧伤患者外周血单核细胞微阵列基因集浓缩分析显示

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    单细胞测序揭示出小鼠后肢发育过程细胞异质性和发育轨迹

    摘要 小鼠后肢基因表达协调和时间调控决定了间质祖细胞特性及其形成肌肉骨骼组织多样性。...为了鉴定肢体发育细胞轨迹,我们使用单细胞mRNA测序(scRNA-seq)来分析E11.5-E18.5之间发育小鼠后肢。...使用RNA荧光原位杂交(FISH)来检查细胞类型和细胞轨迹空间位置,以了解细胞成熟祖先连续体。这些数据为后肢发育转录程序提供了资源,支持肌肉骨骼发育未来研究,和组织再生假设。...样品 取材 E11.5、E13.5、E15.5、E18.5,后肢发育从起始到大致完成4个阶段。 ?...细胞轨迹分析 确定发育轨迹,使用p-Creode,https://github.com/KenLauLab/pCreode ?

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    为什么做拟时序(拟时序一本通01)

    ,是CD16单核细胞慢慢演变成为了两种截然不同CD14单核细胞,如下所示: 值得注意是,这个演变顺序其实可以认为颠倒过来,因为算法推断其实没办法知道发育顺序,仅仅是有有一些基因验证拟时序在变化...,忽略了它在发育学层面的应用,因为我不是发育生物学领域背景。...: 单细胞转录组数据通常是通过捕获大量单个细胞基因表达数据来获取样品细胞多样性。...恢复发育轨迹: 拟时序分析可以帮助恢复细胞发育轨迹,揭示细胞从干细胞到成熟细胞分化过程。...通过构建细胞发育轨迹图,可以将细胞按照它们在发育过程相似性进行聚类,进而研究发育过程关键转变和调控因子。

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    发育大脑结构和功能连接体指纹

    本研究利用发育的人类连接组计划(Human Connectome Project, dHCP)神经影像数据,对早产儿围产期进行两次扫描,以评估发育脑指纹。...发育大脑受动态过程控制,这些动态过程在妊娠早期将几个细胞混合物转变为一个能够快速处理和整合信息复杂器官。胎儿期以皮层迁移过程为标志,这一阶段异常经常导致神经元迁移障碍和非典型大脑结构。...讨论在目前研究,我们使用了一组来自发育的人类连接组项目的独特纵向高质量新生儿大脑MRI数据,来研究神经发育早期阶段连接组指纹状态。...这种影响可能是由个体特有的白质微观结构发育轨迹决定,而不一定表明具有成人特有的结构连接体。大脑发育大致遵循前后成熟轨迹,感觉系统在高阶网络之前发育。...未来研究应该探讨整个发育过程区域差异,全球结构指纹与发育结果关联,以及遗传或环境风险是否会影响指纹稳定性。

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    单细胞测序—PBMC注释细胞类型

    以下是对B细胞及其更细致分类详细介绍:B细胞可以根据其发育阶段、功能和表面标志分为不同亚型。以下是B细胞几种主要分类:(1)B-1 细胞B-1细胞是B细胞一类独特群体,主要存在于腹腔和胸腔。...它们在胚胎期发育,具有独特自我更新能力。(2)B-2 细胞B-2细胞是常规B细胞,存在于大多数淋巴组织和血液。...NK细胞(自然杀伤细胞,Natural Killer Cells)和T细胞(T Lymphocytes)都是来源于骨髓造血干细胞,并且都属于淋巴细胞亚群,因此在发育起源上它们具有一定亲缘关系。...然而,尽管它们在一些功能上有相似之处,它们发育途径和功能特性存在显著差异。发育起源和分化T细胞:T细胞从骨髓造血干细胞分化而来,迁移到胸腺中进一步发育成熟。...NK细胞:NK细胞也是从骨髓造血干细胞分化而来,但其发育不依赖于胸腺,而是在骨髓、淋巴结、脾脏等组织成熟。

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    脑电研究:睡眠婴儿大脑预测发育情况

    (D)长睡眠组记忆测试出现N400成分,暗示着高级发展阶段语义记忆出现。 ? 表1:影响婴儿大脑成熟和认知发育变量。...因此,感知记忆到语义记忆转换需要延长非快速眼动睡眠2(N2)阶段。 如表3所示,长短N2睡眠组被试在影响大脑发育各个变量上也不存在统计学差异,可以排除大脑发育成熟度影响。 ?...图3:在睡眠阶段2记忆形成时间进程。...表2:长短睡眠组不同睡眠阶段时长描述和统计。 ? 表3:长短N2睡眠组睡眠情况描述和发育变量对比。...N2阶段局部睡眠纺锤波参与词汇-语义长时程记忆形成;4. 睡眠依赖记忆巩固(6个月)早于已知发育正常进程(九个月)。

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    monocle2拟时序实战细节剖析(拟时序一本通04)

    ,针对全部单细胞亚群拟时序是不可取,因为这里面有3群是淋巴细胞,它理论上是跟另外CD14单核细胞和CD16单核细胞没有发育关系,但是并不影响我们跑代码啦: 全部单细胞亚群拟时序 但是如果没有这样生物学背景...,就 很容易得到结论是CD14单核细胞会有两个发育方向,一个是我们熟知CD16单核细胞,另外一个发育方向是CD14单核细胞演变成为了淋巴细胞。。。...去除淋巴细胞之后拟时序 从生物学背景角度,CD14单核细胞演变成为了淋巴细胞是不太可能,所以我们应该是纯粹关心我们CD14单核细胞和CD16单核细胞发育关系,如下所示: seurat=seurat...当然了,这个发育是没有方向,所以理论上也可以说是CD16单核细胞会演变成为两个截然不同CD14单核细胞啦。...之前2群是CD16单核细胞,现在编号2群也是CD16单核细胞它也同样分布在两个不同样品里面。

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    纯数据挖掘之仔猪长非编码RNA鉴定

    虽然在各种小鼠组织和细胞系已经系统地鉴定了lincRNA,但在对lincRNA研究仍然很少。因此,寻找和鉴定影响断奶仔猪生长性能lincRNA具有重要意义。...我们还比较了差异表达lincRNAs(DELs)和数量性状位点(QTL)之间位置关系,发现其中一些DELs可能在仔猪生长发育起着重要作用。...我们推测,断奶过渡期间肌肉和脂肪(仔猪发育关键组织)发育可能反映了断奶仔猪生长性能差异。在之前一项研究表现出非常明显肥胖,这在其他动物没有发现。...模型已被用于探索由过量脂肪引起重要疾病,如肥胖、糖尿病、冠心病和动脉硬化。研究肌肉生长也可以使瘦肉型育种提高猪肉利用率)。然而,与人和老鼠相比,对lincRNAs研究还很少。...朱等人于2018年发现miR-146b通过靶向IRS1调节原代脂肪细胞葡萄糖稳态。这些研究表明,发现靶基因确实能够调节肌肉发育和脂肪代谢。 ?

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    文献速递 | 6月单细胞测序文章分享

    与先前关于昆虫附属物发育研究结合起来,研究描述了“望远镜模型”,这是一种外胚层器官发育广义模型,模型,即基板 2D 同心区域外形成了 3D 纵向排列圆柱形空间。...然而,调控不同皮层细胞形成和组织分子仍不清楚,主要因为大量细胞类型在发育时间内会经历动态细胞状态转变。本文通过单细胞RNA测序和染色质可及性测序,得到了发育小鼠新皮质全面图谱。...在肿瘤生长过程,组织驻留巨噬细胞在TME重新分布,而在小鼠和人类非小细胞肺癌单核细胞来源巨噬细胞占主导地位。...接种季节性流感疫苗后,单核细胞和髓系树突状细胞(mDCs)H3K27ac持续减少,与细胞因子对toll样受体刺激反应受损有关。...然而,该疫苗也刺激了单核细胞和mDCs干扰素应答因子(IRF)位点染色质可及性持续增加。这与抗病毒基因表达提高以及不相关寨卡病毒和登革病毒抵抗力提高有关。

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    乳腺癌转移过程异常发育途径

    文章信息 今天分享文章是bioRxiv预印本文章,文章研究概括了在PABC模型致癌过程中出错发育机制。...揭示了PABCcancer progression机理:由alveolar milk secretory cells主导,经由多种Tumor microenvironment (TME) 细胞协助...展示了TMEcellular & molecular pathway network:involution过程不乏各类细胞之间interactions,并具有ECM remodeling与inflammation...:对于ECM-CAFs & involution iCAFs群体:自己内部和自己对他人interaction很高 (key talkers) Immune cells:Myeloid cells...PyMT,各类cell subgroups之间interaction图景(但没有强调Elf5 OE和WT区别) Comment 这篇文章基于一个很好模型 (PABCpreclinical

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    单细胞揭示人胎儿肝造血图谱

    作者利用scRNA-seq检测了约14万个肝脏细胞、7.4万个皮肤、卵黄囊和肾脏细胞,鉴定出了人类发育过程血液和免疫细胞变化过程:他们从HSC/MPPs群推断细胞分化轨迹,评估组织微环境对血细胞和免疫细胞发育影响...此外,通过比较胎儿肝免疫细胞与卵黄囊中免疫细胞以及皮肤和肾脏典型NLTs,构建了胎儿免疫发育网络。...髓样细胞组织特征 小鼠发育轨迹分析已经证实,组织内巨噬细胞是由卵黄囊和胎肝祖细胞产生,而DC细胞则来自骨髓衍生HSC/MPPs,其独立于单核细胞谱系。...相较于人,早在7 PCW时,已可以观察到胎儿肝脏和NLT髓样祖细胞,单核细胞,巨噬细胞以及DC1和DC2细胞簇。 ?...髓样细胞分化路径与相关模式 皮肤和肾脏均存在单核细胞、巨噬细胞、pDC、DC1和DC2细胞;其中NLT单核细胞和DC细胞与胎肝单核细胞和DC细胞高度相关,而巨噬细胞更具组织特异性:对成人巨噬细胞分析发现

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    重磅发布 | 百创智造发布跨物种PBMC数据组

    百创智造DG1000跨物种PBMC数据 外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cell,PBMC)是外周血中具有单个核细胞,包括淋巴细胞和单核细胞,是单细胞免疫相关研究有效载体...“像素“,也迅速成为包括人类、动物和植物在内各种研究不可替代方法[1],帮助科研者能更好地了解器官或组织不同细胞类型、信号模式和发育过程等。...单细胞RNA测序技术应用 单细胞技术跨物种应用 随着单细胞研究发展,现在单细胞研究不再局限于同一物种之中,越来越多研究也涉及多个物种。...研究者发现小胶质细胞表达从啮齿类动物到人类同源基因保守核心基因程序,包括与胶质细胞和神经元之间相互作用相关受体和配体。...进化远端动物小胶质细胞形态定量分析 2022年5月为了确定不同物种间肠道保守性,研究人员收集了小鼠、大鼠、、猕猴和人类回肠组织,随后进行了scRNA-seq分析[3]。

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    会议回顾 | 基因组育种技术助力畜禽水产等动物育种选择及产业应用

    研讨会以中国农业科学院北京畜牧兽医研究所王彦芳研究员“寒冷应激介导脂肪重编程”报告来开场,王老师讲述了现代家现状以及脂肪在生产效益过程经济影响,描述了脂肪性状在品质改良以及寒冷应激重要性并揭示了抗寒机制...厦门大学徐鹏教授在以“大黄鱼抗病基因组选择育种研究”为主题报告,讲述了中国大黄鱼养殖产业发展现状,并从大黄鱼面临产业健康和可持续发展重大瓶颈讲到利用基因组选择技术培育大黄鱼品系,并将液相芯片技术成功应用到水产动物抗病育种实践...华南农业大学聂庆华教授在“黄羽肉鸡种业创新与产业应用”主题讲解,阐述了黄羽肉鸡发展现状及产业化难题,并介绍了研发团队最新科研成果及分子育种技术在黄羽肉鸡育种应用,最后展示了目前黄羽肉鸡产业成果及面临新机遇和挑战...华中农业大学苗义良教授讲述“体细胞重编程与克隆技术创新”中介绍了育种挑战,并围绕卵子成熟机制讲述了颗粒细胞自噬影响卵母细胞发育,并讲述了克隆胚胎发育过程组蛋白甲基化重编程障碍,同时也提出了通过优化卵子成熟体系和消除体细胞重编程障碍创新技术来提升克隆胚胎发育率...最后一位报道嘉宾为华南农业大学吴珍芳课题组丁荣荣博士后,丁博士讲述大型基因组填充数据库构建与应用”,介绍了经济性状遗传解析技术手段,并介绍了目前各种基因芯片面临困境,并介绍了大型基因组填充数据库构建思路与数据库在育种应用

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    王炸组合『单细胞+空间转录组』科研应用【2】:肝脏生理学疾病

    原位空间转录组模型 > 利用scRNA-seq鉴定肝脏发育和再生过程祖细胞 再生是肝脏生理学重要特征之一,但肝胆前体细胞的确切身份和异质性程度尚未完全明确。...在NASH肝脏,LSECs上调了与脂质代谢、趋化因子释放和抗原呈递有关基因表达,而与血管稳态和血管发育有关基因则下调,诱导了窦状毛细血管显著破坏。...LSECs是单核细胞和其他骨髓源性细胞进入肝小叶入口。LSEC与单核细胞相互作用在决定循环单核细胞命运以及它们向肝巨噬细胞分化至关重要。...小鼠模型单细胞分析表明,在NASH肝脏单核细胞衍生巨噬细胞扩张,具有独特炎症表型。...是否NASH-LSECs失调决定了NASH单核细胞来源巨噬细胞表型仍然是未知,需要进一步研究来阐明LSECs与单核细胞在NASH发病机制相互作用。

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    肿瘤浸润骨髓细胞泛癌单细胞转录图谱

    对骨髓细胞进行了无监督聚类,然后根据经典biomarker注释了4种常见细胞类型:肥大细胞、pDC、cDC、单核细胞或巨噬细胞。其中cDCs 和单核细胞或巨噬细胞可以进一步分为多个亚群。...ESCA单核细胞/巨噬细胞进一步细分了6个具有特定基因特征亚群,包括两组单核细胞(经典CD14 hi CD16 - 和非经典CD14 + CD16 hi)和四组巨噬细胞。...然后检查了每种肿瘤类型主要细胞类型组成。单核细胞和巨噬细胞占 TIMs 最大比例,在大多数肿瘤中平均超过 50%。pDCs 谱系是肿瘤部位一个小亚群,包括不到 10% TIM。...LAMP3 + cDCs不同发育起源 接下来,主要关注 cDC 异质性和功能。...为了评估不同肿瘤类型中三个 cDC 亚群相似性,作者观察到来自不同癌症类型相同 cDC 亚群聚集在一起,表明每个 cDC 亚群转录组状态是由发育决定,其中癌症类型影响相对较小。

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    人血细胞单细胞转录组图谱

    CEBP和SPI1在中性粒细胞/单核细胞显示出高活性,而GATA1和KLF1在红系中被激活(图2C)。...值得注意是,单核细胞和中性粒细胞共享大多数髓系特有的调节子基因,而淋巴细胞调节子则有着明显细胞类型特异性,在B淋巴细胞成熟过程调节子变化证明了这一特点(图2C)。...Fig 2.Transcription factor regulatory networks underlie hematopoiesis 3.单细胞转录组非编码RNA图谱 LncRNAs在造血细胞分化和发育过程起着至关重要作用...他们发现,在红系谱系,Ery/Gra1和Ery/Gra2显示了与中性粒细胞和单核细胞/树突状细胞(MD)特征相关高表达基因(图4A)。...在线数据库有助于我们在单细胞水平上找到某特定基因在32种血细胞表达水平变化,以及可以利用自己数据绘制发育分化轨迹图谱。

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    单细胞多组学分析揭示人发育过程造血景观

    研究背景 在胚胎发育过程,造血干细胞(HSCs)需要快速分化为成熟血细胞。我们目前对胎儿造血干细胞和祖细胞(HSPC)了解主要是通过小鼠和体外模型系统来推进。...关于人类发育过程造血调控仍不明确。...图1 人胎儿血细胞生成单细胞转录组分析 2 胎儿造血过程中分化轨迹分析 分析人类胎儿发育过程造血细胞分化轨迹,HSC/MPP向MEMP过渡差异基因包括MK/类红细胞/肥大细胞谱系特异性基因(GATA1IT...FOXO3对类红细胞高度特异性,而EOMES、OLIG2和IRF8分别对NK细胞、单核细胞和pDC具有高度特异性。...综上,得出HSC/MPP下游存在3个寡能祖细胞群:MEMP产生红系细胞、MK和肥大细胞;GP分化为粒细胞;LMP产生淋巴样细胞、单核细胞和树突状细胞。

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    全球首个人猴嵌合体胚胎:中外学者联合构建,研究登上《细胞》杂志

    这种有机体可以在发育自然形成,比如早期融合异卵双胞胎。此外,从技术上讲,器官移植也可以人为地产生嵌合体。其中,人类 - 动物嵌合体争议最多,但国内外学者并没有停止该领域研究。...这也是首次证明人类细胞能够在另一只动物胚泡内生长。 ? 人嵌体胚胎。 问题在于人和是完全不同物种,人类干细胞在植入胚胎内无法起作用,二者之间隔着数千万年进化差异。...研究者首先使猴子胚胎器官发育所需基因失去活性,然后注入人体干细胞,最后在猴子胚胎中发育人体器官。...24 小时后,研究者可在 132 个胚胎检测到人类细胞;10 天后,仍有 103 个嵌合体胚胎在发育。随后存活率开始下降,直到第 19 天,只有三个嵌合体还活着。...因此,胚胎是在实验室培育(而不是代产体),并且没有发育超过 20 天期限。

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