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    腾讯多媒体实验室参会IJCAI2019并做论文报告

    我们提出的系统框架图如上图所示,其中MKTB和GRB模块为时域建模模块,这两个模块可以直接插入到已有的2DCNN中。另外,该方案是基于经典的TSN([Wang L et al....图8-所提出的GRB模块   MKTB模块中用的是DepthWise的时域卷积进行时域建模,这种卷积会对每个通道单独的进行计算,而忽略了通道间的全局关系建模。...为了进一步弥补这种全局信息的缺失,我们提出一个全局调优模块GRB。该模块受Non-Local网络的启发,即利用跨通道的全局关系对特征做进一步学习。...不同于原有的Non-Local模块用在网络较前的位置,该模块很自然地用在我们的网络后端(分类层前),此时,输入特征已经不含空域维度,所以GRB模块中仍然是1D卷积而不是Non-Local模块中的2D或者...3D卷积,所以该GRB模块计算量较低。

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    Nature | 蛋白质遗传结构很复杂?Ben Lehner使用加性能量模型得出相反结论!

    例如,利用一个浅层双突变体库,作者能够推断适配蛋白GRB2的C末端SH3结构域中几乎所有突变(1,056/1,064 = 99%)的折叠吉布斯自由能变化(ΔΔGf)。...在GRB2-SH3结构域中随机组合突变会很快导致蛋白质不能折叠,预计当有五个和十个突变时,分别约有98%和超过99.9%的基因型无法折叠(基于加性能量,见图1a)。...对于GRB2-SH3,预测能够保留两种分子表型的最大突变集包含34个单一氨基酸替换:25个位于表面残基(相对溶剂可及表面积(RSASA)≥ 0.25),3个位于蛋白质核心(RSASA < 0.25),6...高阶突变体的折叠和功能 图 4 作者的实验鉴定了大量GRB2-SH3基因型,尽管带有多次突变,但仍然具有较高的细胞丰度(例如,包含超过五个突变的25,564种基因型;见图1f)。...因此,大多数高丰度的高阶GRB2-SH3突变体是正确折叠的。 多表型遗传预测 在大量遗传背景中,测量了这两个相关分子表型的单氨基酸和双氨基酸突变效应,这为热力学建模提供了丰富的数据来源。

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