用Pycharm误删了Anaconda下的python软链接,重新ln -s后再输入conda的任何命令都不能运行了; stackoverflow上的相关问题也比较少,没有一个能解决误删这种坑的,记录如下...: Traceback (most recent call last): File "/home/name/anaconda3/bin/conda", line 7, in module> ...from conda.cli import main ImportError: No module named conda.cli 显示如上错误时,如果实在找不到问题,可以找到Anaconda的安装bash...文件“ABCD.sh”,然后输入bash -u ABCD.sh更新一下 就可以直接解决以上问题,且之前在Anaconda下安装的包和环境都不会丢失。。。...我主要是为了懒得再安装一遍tensorflow。
技术背景 在上一篇博客中执行过conda的更新以及用conda安装了gxx_linux-64之后,再执行pip的一些指令时,就会给出如下所示的报错: $ python3 -m pip list Traceback...named '_sysconfigdata_x86_64_conda_linux_gnu' 问题定位与解决 经过一圈的检索,最后对问题的出现原因定位为:在某一个版本的python中丢失了一个备份文件,...通常在同一个版本的python下会有两个相同的_sysconfigdata_x86_64_conda_cos6_linux_gnu.py文件和_sysconfigdata_x86_64_conda_linux_gnu.py..._64_conda_cos6_linux_gnu.py /home/dechin/anaconda3/lib/python3.8/_sysconfigdata_x86_64_conda_linux_gnu.py...总结概要 在近期conda的版本更新中,有可能会删除路径下的_sysconfigdata_x86_64_conda_linux_gnu模块相关备份文件,而在其他的一些软件的运行过程中有可能依赖于这个备份文件
发现是centos 自身的bug,尝试无果后:Oracle 服务器CentOS 修复 ‘No module named ‘librepo’ ‘ – 苔原带[3] 打算重新安装ubuntu:Canonical-Ubuntu...3-基本配置 安装基本依赖: sudo -i # 切换root apt-get install wget apt-get update -y && apt-get install curl -y 修改...4.2-一些软件 通常我并不会设置: # conda config --set auto_activate_base false 即我会默认让服务器开启后,自动进入base 的conda 环境。...接着我会用conda 安装一些软件。...named ‘librepo’ ‘ – 苔原带: https://tundrazone.com/oracle-fuwuqicentos-xiufu-no-module-named-librepo/ [
安装好 PyTorch1.5.0 之后,在 Anaconda Prompt 中激活新创建的环境变量之后,import torch 并 打印 torch 的版本没有问题,说明 PyTorch 已经安装成功...但是打开 Jupyter Notebook 后 import torch 却提示 “No module named torch” 报错如下: 我们还需要在这个环境安装 jupyter notebook...的一系列依赖库 conda install jupyter 接着在这个环境变量中安装nb_conda(关键) conda install nb_conda 重启 jupyter notebook 后再进入
安装 conda或者pip安装: conda install -c bioconda deeptools # 或者 pip install deeptools github源代码安装: git clone...https://github.com/deeptools/deepTools.git wget https://github.com/deeptools/deepTools/archive/1.5.12...,bam2Coverage可能会引发如下错误: "The XXX file does not have BAM or CRAM format"; "ModuleNotFoundError: No module...named 'numpy.core.
leotao的建议 不要让conda在安装时,把path加到系统里去,要用的时候激活 激活后,用conda install -p /path/for/biotools/把 生信软件装到特定位置,而且这个位置的...python版本最好和系统的一样 把这个 /path/for/biotools/ 加入到系统path 可能这样做后,反激活conda后生信软件也能用,同时不会污染环境 另外附上一篇还未公布的笔记: conda...安装的R语言初次使用会报错 我个人是很反对使用conda来安装R语言,但是很多时候conda安装的软件会依赖R,而conda比较实诚,一定要自己安装自己的R,而不是使用系统环境的。...通常conda本身就在我们的环境变量里面,而且优先级很高。那么conda一旦选择安装了自己的R,就会替代我们的R。...安装了icu后获得的,那么我应该是要安装特定版本的icu才行。
2.软件环境准备 软件安装使用conda进行,需要几个G的空间,由于电脑配置有限,教程可能止步于某个对配置要求特别高的地方,后面如果运算时间不长,下载数据量不大,内存和核心数要求不太高,成本可以接受的话可以考虑使用腾讯云...#首先安装conda, 添加清华源加速,教程有很多,这里省略 #建立一个新的工作环境 conda create -n tara #激活工作环境 source activate tara #安装所需软件...,如果后面要把环境打包,可以导出一个环境的软件安装列表,如果哪天可以整体打包文件就好了 #conda env export -n tara -f $PROJECT/tara_conda_environment.yaml...#安装conda中没有的其他软件 cd wget https://bintray.com/artifact/download/blahah/generic...wget -O mmetsp-k31-named.tar.gz https://osf.io/cdvqn/download #使用一个for循环解压数据 for infile in *.tar.gz;
操作步骤 登录云服务器,安装文件下载工具wget和文本编辑器vim,命令行如下: $ sudo apt(yum) install -y wget vim 下载Conda的安装程序,这里推荐使用清华大学镜像源...运行下载好的可执行文件,安装Conda,运行命令行如下所示,安装完后可能需要添加环境变量 # 安装Conda $ sh Anaconda3-5.3.1-Linux-x86.sh # 添加Conda为环境变量...安装依赖 第一步指出预先准备安装两个工具,分别为:wget和vim。...创建Python版本环境 在使用命令$ conda create -n py37 python=3.7.11 -y创建Python版本环境后,会提示同步安装相关依赖,按照提示输入y即可, 7....切换Python版本环境 可以参数步骤6创建多个Python版本环境,后使用conda activate命令进行切换。
安装如下方法安装python2.7: yum install –y python27 python27-devel python-docutils cd /usr/bin/ rm -rf python...cp python2.7 python 出现yum错误:No module named yum 解决方法,查看 /usr/bin下python有哪几个版本 ll /usr/bin 我这里是:2.6 和...2.7 (刚安装的) 由于yum命令不兼容python2.7,需修改**/usr/bin/yum**文件,vi /usr/bin/yum打开,将第一行由“#!
那么我们接下来就来看看如何使用这个RFdiffusion,今天讲的版本是在实验室的服务器上安装的版本,下一篇文章我们讲一下如何在colab上使用。...se3-transformer conda env create -f env/SE3nv.yml 这一步需要特别说明一下 请CD到你的RFdiffusion文件夹里 才能好到env下的yml环境文件...然后就是继续安装: conda activate SE3nv cd env/SE3Transformer pip install --no-cache-dir -r requirements.txt...../.. # change into the root directory of the repository pip install -e . # install the rfdiffusion module...from the root of the repository 最后安装完成使用的时候需要记得激活刚刚创建的SE3nv虚拟环境 conda activate SE3nv 这就是安装篇,关于colab
Anacodna相关操作 下载安装以及切换镜像 #下载和安装anaconda wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/Anaconda3...深度学习环境创建 注意不需要手动配置cuda和cudnn,直接conda安装 TF环境 1.x推荐1.14.0版本 conda install tensorflow-gpu==1.14.0 #conda...=10.0 在线安装失败 有可能因为网络原因下载失败,因此可以先下载然后本地安装,tf和torch也类似 cuda和cudnn安装 wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn...#本地安装 wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/linux-64/cudatoolkit-10.0.130-0.tar.bz2...conda install cudatoolkit-10.0.130-0.tar.bz2 #本地安装 pytorch gpu版本 wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn
安装conda 「Ubuntu安装Anaconda及注意事项」 2....安装hbase-thrift-0.20.0.patch 新建一个Python3.9的anaconda环境 root@node01:~$ conda create -n test python=3.9...$ python3 setup.py install ❝报错 ❞ Traceback (most recent call last): File "setup.py", line 2, in module...> from setuptools import setup, find_packages ImportError: No module named 'setuptools' ❝按照提示,下载...local/$ wget https://mirrors.aliyun.com/apache/thrift/0.16.0/thrift-0.16.0.tar.gz?
.sh 下载完成后输入: bash Anaconda3-2023.07-1-Linux-x86_64.sh 下面开始敲n次enter后,直到出现下图界面,输入yes确认安装(注意不要敲过头,否则只能重新开始...Traceback (most recent call last): File "entry_point.py", line 76, in module> File "tarfile.py",...可以使用以下命令重新下载文件: wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2023.07-1-Linux-x86_64.sh 验证文件完整性:下载完成后...如果尝试上述方法后仍然遇到问题,请确保您的系统环境和安装步骤正确,并考虑查阅Anaconda官方文档或社区支持以获取更进一步的帮助。...选yes后,启动虚拟机,会出现当前环境(base)字样 换源 conda config --set show_channel_urls yes 可以用记事本打开,增加以下内容保存并退出,修改为清华源 channels
conda 使用以下命令查看 Anaconda 是否已成功安装: conda --version 若安装成功,会出现版本号信息。...在终端中使用wget命令下载Miniconda安装程序。...下载完成后,运行以下命令来安装Miniconda: ``` bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh ``` 4....安装完毕后,可以输入以下命令使环境变量立即生效: source ~/.bashrc #必须要执行,否则找不到 conda 5. 安装完成后,重新打开终端,验证conda是否成功安装。...运行以下命令: conda --version 如果成功安装,会显示conda的版本号。 现在你已经成功在CentOS上安装了conda。
linux环境下的软件安装今天这部分比较痛苦……因为我用的是自己的MacBook的terminal,第一个指令wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda...,并且由于我还开着代理,失败了几次后终于意识到是代理的问题……终于:/bin/bash -c "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew...基础工作完成了,开始下载wget:brew install wget下好了之后,去清华的conda镜像网站下载miniconda,一开始下错了,下成Linux版了,死活安装不了……最后发现应该选mac版...最后可以设置镜像,和homebrew的镜像一样,总之就是为了加快速度…………接下来正式使用conda:conda install fastqc -y(-y)很关键最后加一个conda环境:conda create...-n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y搞一个python版本是3的conda环境来安装fastqc、trimmomatic。
wget https://repo.continuum.io/archive/Anaconda3-5.0.1-Linux-x86_64.sh 下载完成成后直接进行安装: bash Anaconda3-5.0.1...-Linux-x86_64.sh 安装过程中会需要不断回车来阅读并同意license。...为了保持更新,可以在终端中执行: conda upgrade --all 如果报下面的错误,很可能是因为设置了PYTHONPATH环境变量。...Traceback (most recent call last): File "/home/*****/anaconda3/bin/conda", line 4, in module>...Anaconda默认不带opencv包,而且无法直接使用系统已安装的opencv,需要用户在Anaconda下再次安装,命令如下:(如果出错可以多重覆几次) conda install --channel
chatgpt:wget 是一个命令行工具,它用于从网络上下载文件。全称是 "Web Get"。它支持通过HTTP、HTTPS和FTP协议下载文件。...wget 非常强大,可以通过各种方式来下载文件,包括在后台下载、断点续传、批量下载等。...然后出现这个界面:3.下载完成后,运行 :bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh,然后开始安装过程4.激活:source ~/.bashrc(注意空格)生信星球:激活不成功就将...config --set show_channel_urls yes生信星球三、开始使用conda1.查看当前服务器上安装的所有软件列表 conda list2.安装软件 conda install fastqc...-y或conda install fastqc=0.11.7 -y3.确认fastqc软件是否安装成功 fastqc --help注意:在安装软件的时候一定等彻底安装好再下一步,要不然会出现乱码!!!
No module named setuptools wget --no-check-certificate https://bootstrap.pypa.io/ez_setup.py python2.7...named _sqlite3 yum install sqlite-devel cd /opt/Python2.7.3 ....(建议)yum不可用的情况(No module named yum) 通常这种情况可以采用如下方式修复,重新下载系统原有的包进行安装修复 # 下载对应操作系统rpm包 wget http://mirrors.ustc.edu.cn...named zlib yum install zlib # 重新编译Python ....其实还可以使用venv、conda来解决这类问题,但是不想依赖第三方工具,所以没研究,后续会补充这方面文章。
# 或者用代码安装,特别慢建议不要# 选择适合自己电脑的miniforge版本# 两种下载方式,wget需要额外安装curl -L -O "https://github.com/conda-forge.../miniforge/releases/latest/download/Miniforge3-$(uname)-$(uname -m).sh"wget "https://github.com/conda-forge.../miniforge/releases/latest/download/Miniforge3-MacOSX-arm64.sh"wget "https://github.com/conda-forge/miniforge....sh安装完成之后我们可以看当前有哪些环境并且安装在什么conda之下omicverse安装流程安装完miniforge之后,再尝试安装一个环境1.创建环境CONDA_SUBDIR=osx-arm64...torch_sparse torch_cluster torch_spline_conv -f https://data.pyg.org/whl/torch-${TORCH}+${CUDA}.html# 修改后pip
怎样在Linux上安装conda?为了生信分析的需求,我们安装Miniconda即可。图片1....https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_22.11.1-1-Linux-x86_64.sh # wget是一个linux...系统自带的可在网络上进行下载的简单而强大的自由软件,wget + 下载链接 即可下载下来3.安装miniconda我们使用ls命令可以看到一个.sh后缀的文件,这个文件就是安装包。...查看、创建、切换环境conda env list 或 conda info --envs # 查看已有环境我们在安装完conda后,自动会创建一个名为base的基础环境,后面的*号说明我们目前处在这个环境中...删除指定环境---使用conda安装软件conda list #首先我们可以先查看当前环境中安装了哪些软件conda install fastqc -y # 安装fastqc到当前环境中,-y参数表示同意安装过程中的所有询问