题，譬如现在有一串字符串s1=“agtcgtaatgc”,想将另一个字符串s2="cgaa"比对到s1上，可以看到s2并非完全比对到s1上面，其中是有一个错配的。现在我要实现的就是寻找s2比对到s1上面的错配最少的位点。
浏览 779提问于2017-11-27
我想提取两个字符串(DNA序列)并生成比对分数。我找到了解密包，但它只允许我生成比对，而不是比对分数。我也试过使用“生物字符串”，但我无法生成分数。 谢谢你的帮忙!
浏览 9提问于2019-08-30得票数 0
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在js中，So...there是一种叫做Map的类型，它实际上是nice...it，在迭代和计算方面比对象更快，所以我真的很喜欢它。However...you不能像处理对象那样传递贴图。有没有一种方法可以将Map序列化为字符串，这样我就可以做相反的事情--从前面提到的序列化的Map到最终的Map
优选地，这种方法应该像JSON.stringify或其对应的JSON.parse一样容易执行我想使用Map，因为它更快更好，但我需要将数据作为字符串发送。字符串的格式并不重要，只要我能将其解析回
浏览 4提问于2018-05-03得票数 13
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在python中使用regex列表搜索和替换1 1GB文件中的一些特殊字符。 for i, j in dic.iteritems(): return text
目前在1 GB的测试文件中性能良好。我想知道
浏览 3提问于2014-09-17得票数 0
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如果我有一个从服务器收到的JSON数组，我想(例如)将它用于自动补全-我只需要创建一个JavaScript数组，并使用循环将JSON值放入数组中，然后将其用于我的自动补全。谢谢！
浏览 0提问于2011-11-03得票数 1
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我有数以千计的DNA序列，范围在100到5000 bp之间，我需要对指定对进行比对并计算身份得分。the scriptjob 4945543.1 died through signal XCPU (24)
我知道还有其他用于比对的工具，但它们主要只能将比分写入输出文件中，需要再次读取和解析，以便检索和使用比对分数。有没有什么工具可以像pairwise2那样在python环境中对序列进行比对并返回比对分数，而不会造成
浏览 1提问于2015-11-10得票数 4
我已经写了一个powershell脚本来捕获McAfee AVDate，它也给出了输出。但这里的问题是，我在脚本中添加了另一行，如果McAfee AVDate日期比当前日期早2天，则应该以红色显示McAfee AVdate，但这在这里不起作用。 $AVDate = (Get-ItemProperty -Path "HKLM:\SOFTWARE\Wow6432Node\McAfee\AVEngine").AVDatDate$thedate = get-date -date $(get-date).addda
浏览 1提问于2017-08-30得票数 0
现想解析群聊中群发视频邀请后产生的自定义消息，无奈无法将所有情况面面俱到，请问有详尽的类型比对吗
image.png
浏览 141提问于2021-10-15
我使用AntiXssEncoder.UrlEncode对查询字符串参数中的值进行编码。空格被编码为%20，但我想使用加号代替。有没有比对结果字符串调用.Replace("%20"，"+")更好的方法呢？
浏览 1提问于2016-07-01得票数 0
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我可以在执行Node.JS时强制安装npm-package而不是触发错误吗？
它将比对每个包运行npm i package更方便。
浏览 8提问于2016-11-23得票数 3
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在节点缓存的最佳方法
、、、
在用于Node.js的google文档中，它只推荐，对于其他语言，它有本机memcache。有没有比对redis进行外部调用更好的缓存系统？
浏览 6提问于2017-08-31得票数 2
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因此，我最近启动了一个关于序列比对的项目，并一直使用独立的软件程序'MAFFT‘来比对一些BRCA1序列(通过。我已经使用以下代码解析了aln文件：print(align)
align
浏览 24提问于2020-05-05得票数 0
样式似乎是支持比对象样式更多功能的主要接口。const Button = styled.button``
在StyledComponent或Emotion.js中，css-string (模板)样式比对象样式更喜欢
浏览 3提问于2019-10-13得票数 2
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我有一个8个碱基的字符串testStr我想把它与绿色的8个碱基字符串greenList的列表进行比较。GGCGCATG ACTGAAAT ATGCCCGT ACTGAGTG||||| ||我第一次尝试这样做的中心是创建一个绿色列表，其中包含了greenList中字符串的所有可能的hamming距离1变体。但一定有更好的方法.我也知道有大量的
浏览 7提问于2020-12-11得票数 0
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如何计算文本字符串的多序列比对
、、、、
我正在写一个程序，它必须计算一组字符串集的。我正在考虑用Python来做这件事，但如果更实用的话，我可以使用外部软件或其他语言。数据不是特别大，我没有很强的性能要求，我可以容忍近似(即。唯一的问题是字符串是常规字符串(即，UTF-8字符串(可能包含应被视为常规字符的换行符)；它们不是DNA序列或蛋白质序列。我可以找到大量的工具和信息，用于生物信息学中的常见情况，具有特定的复杂文件格式和许多我不需要的功能，但出人意料地很难找到用于简单字符串情况的软件、库或示例代码。我可能会重新实现解决这个问题的众多算法中的
浏览 1提问于2011-04-28得票数 22
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我正在寻找一个库，它可以使用定义BNF的字符串，而另一个字符串可以根据前者解析和解析文本。请注意，我不想要需要用源代码形式编写定义的东西，然后需要编译
浏览 5提问于2014-12-07得票数 4
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前两个解析为预期的重载。很明显，第二个参数是一个字符串，它会抛出编译器。如果它不是字符串(第二种情况)，则分辨率很好。但显然(对我而言)失败的行应绑定到"Bar()“(因为第一个参数明确地是一个字符串)。
浏览 0提问于2012-05-17得票数 1
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我希望能够使用我在与脚本相同的目录中下载的文件来编写多个序列比对。然而，在Biopython Cookbook中，显示这一点的唯一方式是通过写出字符串而不是加载文件。我希望能够做到后者。下面是在中进行多序列比对的方法from Bio.SeqRecord import SeqRecord
from Bio.Align import MultipleSeqAlignment
浏览 31提问于2019-12-01得票数 0
我需要计算短字符串序列(<20个字符)和几千个字符串之间的比对(相似性)分数。
我无法弄清楚这两种算法之间的差异，也无法决定为我的工作选择哪种算法。有没有人能帮我弄清楚其中的区别？
浏览 0提问于2011-08-05得票数 7
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