题，譬如现在有一串字符串s1=“agtcgtaatgc”,想将另一个字符串s2="cgaa"比对到s1上，可以看到s2并非完全比对到s1上面，其中是有一个错配的。现在我要实现的就是寻找s2比对到s1上面的错配最少的位点。
浏览 779提问于2017-11-27
我想提取两个字符串(DNA序列)并生成比对分数。我找到了解密包，但它只允许我生成比对，而不是比对分数。我也试过使用“生物字符串”，但我无法生成分数。 谢谢你的帮忙!
浏览 9提问于2019-08-30得票数 0
回答已采纳
我使用AntiXssEncoder.UrlEncode对查询字符串参数中的值进行编码。空格被编码为%20，但我想使用加号代替。有没有比对结果字符串调用.Replace("%20"，"+")更好的方法呢？
浏览 1提问于2016-07-01得票数 0
1回答
我有一个8个碱基的字符串testStr我想把它与绿色的8个碱基字符串greenList的列表进行比较。GGCGCATG ACTGAAAT ATGCCCGT ACTGAGTG||||| ||我第一次尝试这样做的中心是创建一个绿色列表，其中包含了greenList中字符串的所有可能的hamming距离1变体。但一定有更好的方法.我也知道有大量的
浏览 7提问于2020-12-11得票数 0
回答已采纳
4回答
如何计算文本字符串的多序列比对
、、、、
我正在写一个程序，它必须计算一组字符串集的。我正在考虑用Python来做这件事，但如果更实用的话，我可以使用外部软件或其他语言。数据不是特别大，我没有很强的性能要求，我可以容忍近似(即。唯一的问题是字符串是常规字符串(即，UTF-8字符串(可能包含应被视为常规字符的换行符)；它们不是DNA序列或蛋白质序列。我可以找到大量的工具和信息，用于生物信息学中的常见情况，具有特定的复杂文件格式和许多我不需要的功能，但出人意料地很难找到用于简单字符串情况的软件、库或示例代码。我可能会重新实现解决这个问题的众多算法中的
浏览 1提问于2011-04-28得票数 22
回答已采纳
1回答
我正在寻找一个在视窗和Linux上使用C#的NoSQL数据库。我更喜欢这样的解决方案，我可以在我的应用程序中拥有DB服务器(作为程序集".dll")，并且不需要专用服务器。原生Mono支持将比对现有数据库解决方案(如 )打补丁更好
谢谢你的帮助。
浏览 3提问于2012-05-30得票数 0
回答已采纳
我希望能够使用我在与脚本相同的目录中下载的文件来编写多个序列比对。然而，在Biopython Cookbook中，显示这一点的唯一方式是通过写出字符串而不是加载文件。我希望能够做到后者。下面是在中进行多序列比对的方法from Bio.SeqRecord import SeqRecord
from Bio.Align import MultipleSeqAlignment
浏览 31提问于2019-12-01得票数 0
我在Linux机器上，试图用Tomcat 6实例替换Apache2实例。我通过在适当的pid上运行杀死来关闭Apache实例，但是当我试图访问任何页面时，我会得到一个错误504，而不是404。对端口80的请求返回速度比对端口8080的请求快得多。你知道我能做些什么让Tomcat 6启动并运行吗？
浏览 0提问于2011-10-12得票数 0
回答已采纳
我需要计算短字符串序列(<20个字符)和几千个字符串之间的比对(相似性)分数。
我无法弄清楚这两种算法之间的差异，也无法决定为我的工作选择哪种算法。有没有人能帮我弄清楚其中的区别？
浏览 0提问于2011-08-05得票数 7
回答已采纳
长话短说，我有一个重要的Python应用程序，它在Linux上比对"losetup“、"mount”等的调用更好。本质上是消耗系统资源，这些资源必须在完成时释放。
浏览 1提问于2008-09-18得票数 12
回答已采纳
3回答
他像标准一样将原语定义为数字、字符串、布尔值、空值和未定义的原语。因为他们有自己的方法和复杂的实体。实际问题
在定义字符串、布尔值和数字时，原始对象会比对象更精确吗？
浏览 4提问于2013-01-18得票数 4
回答已采纳
1回答
是否有任何gem或库可用于根据给定的类似百分比对文本进行分组。以上所有的宝石都有助于发现两个字符串之间的相似之处，但是分组大量的数据需要花费大量的时间。
浏览 5提问于2017-01-28得票数 0
回答已采纳
. &我对Windows比对Linux更熟悉。是否有与start命令等效的Linux？
浏览 1提问于2012-11-16得票数 1
4回答
如何在R中执行基本的多序列比对？
、、、、
(我试过在上问这个问题，但文本挖掘的人可能会认为有更好的解决方案，所以我也在这里转发这篇文章)我没有一个基本的模式可以匹配。data.frame(Real_sequence = seqS4, The_sequence_we_see = all.seqS)library
浏览 2提问于2010-12-21得票数 9
回答已采纳
2回答
我想知道是否有人知道有什么工具可以让我在多序列比对中的任何特定位置计算氨基酸的频率。我对R和Linux很熟悉，但如果有其他软件可以做到这一点，我相信我可以学到。
浏览 11提问于2022-09-09得票数 0
目前，我正在与GnuPG合作我的一个新项目。了解手册中没有描述的两件事是非常有用的：GnuPG使用什么键派生函数？
浏览 0提问于2017-07-08得票数 2
回答已采纳
扫码
添加站长 进交流群
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
相关资讯
热门标签
云服务器
ICP备案
对象存储
腾讯会议
实时音视频活动推荐
腾讯云开发者
