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python之linux下pdb试调

编写一个简单程序用pdb试调一下，代码如下 #!...)) minnum = getminnum(numlist) print(u'列表中最小值为:{}'.format(minnum)) 这是一个输入数字添加到列表，挑选最大最小值的程序 linux...里python程序调试pdb命令如下 python -m pdb linux_pdb.py ?...pdb的所有命令 list : 显示程序，可以带参数，比如显示第五行 list 5 break : 添加断点，比如在第5行添加断点break 5，在getlist函数添加断点break run : 开始运行程序...step : 单步运行，进入函数内部 next : 单步运行，不进入函数内部 print : 显示参数 quit : 退出pdb

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PDB 文件

PDB 文件 ---- 什么是 PDB 文件 PDB (Program Data Base) 即程序的基本数据，是 VS 编译链接时生成的文件，每个程序集（EXE 或 DLL）都有一个与之对应的 PDB...PDB 文件中都包含哪些内容通过上一小节的例子，大家对 PDB 文件有了大概的了解，知道其中存储了代码行号等信息。...PDB 的唯一性和重要性每个程序集（PE 文件，EXE 或 DLL）都会有一个与之对应的 PDB 文件，并且每次编译生成的 PE\PDB 文件都不同。...编译器会生成一个 GUID 存储在 PE\PDB 文件中，以此来映射 PE 文件和 PDB 文件。...由于 PDB 文件具有唯一性，因此 PDB 文件和 PE 文件同等重要，一旦丢失就不能通过重新编译来获取。

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pdb && cProfile

pdb https://docs.python.org/zh-cn/3.7/library/pdb.html#module-pdb 使用方式 1、在命令行下直接运行调试 python -m pdb...2、在需要被调试的代码中添加import pdb、pdb.set_trace()再运行代码进行调试 # test.py def func(): print('enter func()') a...= 1 b = 2 import pdb pdb.set_trace() # 运行到此处启动pdb func() c = 3 print(a + b + c) ?...执行下一条语句，如果是函数，则会进入函数内，显示–call–，执行函数内第一条语句，执行完函数内语句后跳出显示–return– b 列出当前所有断点 b lineno 在某行添加断点 cl 清除断点 q 退出调试pdb

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c# pdb文件_pdb文件是什么

C++编译生成的pdb文件就是符号表。这些符号表，程序运行的时候没有用。...但调试的时候有用，主要记录如下东西：全局变量局部变量函数名及其实体指针地址帧指针表源代码行数使用pdb文件进行调试，要和当前运行的程序一致。

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PDB文件详解

PDB文件的介绍 PDB（Program Data Base），意即程序的基本数据，是VS编译链接时生成的文件。...所以完全通过PDB文件调试，意义与作用均没有多大。如果要让其他人能够调试自已的代码，PDB文件和源码都应该提供，只提供PDB文件的意义不大。如果确实有类似的需求，可以保留相应生成的PDB文件。...微软的很多库默认是不提供PDB文件的，但是近来微软逐渐开放了一些库的PDB文件。 VS搜索PDB文件的路径顺序 MSDN中详细的讲述： 1....静态库的PDB文件静态库也有自已的PDB文件，只不过其名字是VC80.PDB/VC100.PDB这样的名字。静态库的PDB文件会在链接时合并到EXE/DLL的PDB文件中去。...如果生成的静态库lib里有记录相应的PDB文件，却又没有相应的PDB文件，那么静态库链接成EXE/DLL时就会报警告找不到静态库对应的PDB文件。

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PDB文件说明

PDB可以经由网络免费访问，是结构生物学研究中的重要资源。为了确保PDB资料的完备与权威，各个主要的科学杂志、基金组织会要求科学家将自己的研究成果提交给PDB。...PDB数据库存储结构数据的文件是PDB文件，每一个蛋白质或核酸都对应着一个编号，即PDBID，文件的扩展名为.pdb。...PDB文件可以由各种3D结构显示软件打开，比如pymol，Swiss-PDB viewer，VMD等。PDB文件里面的信息是有严格的格式的。...PDB数据库存储结构数据的文件是PDB文件，每一个蛋白质或核酸都对应着一个编号，即PDBID，文件的扩展名为.pdb。...参考资料 PDB文件的格式 PDB文件详解有关原子坐标文件 WOLFRAM 语言 IMPORT/EXPORT 格式 PDB 教你读懂蛋白的PDB文件 PDB 文件格式

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关于pdb文件

关于pdb文件当程序在 VS 上编译时，程序所依赖的所有动态链接库（dll 文件）也会被编译，编译过程中每个 dll 都会产生一个pdb文件，又称为“符号文件”，是一个存储数据的信息文件，其包含 dll...当使用VS 调试程序时，会默认加载你的程序以及程序依赖的dll库产生的所有pdb文件，但是结果往往是VS自己找不到依赖库的pdb文件，于是就提示给你“无法查找或打开pdb文件“。

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Python pdb调试

Python提供了pdb命令来对代码进行调试，下面是pdb的使用方法。...(2)() -> b = 0 (Pdb) n > c:\users\hongze\test.py(3)() -> print(1/0) (Pdb) p a...-> print(1/0) (Pdb) n --Return-- > c:\users\hongze\test.py(3)()->None -> print(1/0) (Pdb) q...import pdb，在需要的地方加上pdb.set_trace()，就相当于设置了一个断点，调试将从断点处执行，上面的命令依然可用，输入c继续执行。...import pdb a = 1 b = 0 pdb.set_trace() print(1/0) #pdb 断点调试实例 C:\Users\hongze>python test.py > c:\

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处理pdb文件

import os from math import sqrt import numpy import torch from Bio.PDB import PDBParser from torch.utils.data...P450Dataset(Dataset): def __init__(self, testp450, transform=None, target_transform=None): # 处理pdb...testp450' arr = [] max_num = 0 index = 0 self.data = [] # 遍历文件夹下的pdb

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blast+本地化中blastp操作(基于PDB库)—linux

ncbi-blast-2.9.0+-x64-win64.tar.gz 对安装包进行解压: [wangh@master Softbacks]$ tar -zxvf ncbi-blast-2.9.0+-x64-linux.tar.gz...-2.9.0+]$ source ~/.bashrc #刷新你的环境配置文件，使得系统识别你刚加入的环境变量(也可以关闭当前终端再次打开，系统自动刷新环境配置文件) blastp 的用法：数据库从PDB...中下载: ftp://ftp.wwpdb.org/pub/pdb/derived_data/pdb_seqres.txt 用cd-hit处理去冗余(解压后加变量后就能用) $: cd-hit -i /path.../pdb_seqres_simp.fasta -o PDB_simp.fasta -c 0.9 格式化数据库： $: makeblastdb –in PDB_simp.fasta –dbtype prot...–out PDB -in:待格式化处理的fasta文件(一般是从PDB/NCBI里下载所有的相关或者整个库中的序列); -dbtype: 数据库类型，prot或者nucl; -out: 输出的数据库名

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Oracle重命名PDB

脚本 -- 步骤1、启动pdb到受限模式（在pdb里边操作） alter session set container=pdblhr3; alter pluggable database pdblhr3...pluggable database pdblhr3 open restricted; -- 或： shutdown immediate startup open restrict -- 步骤2、进入pdb...里边对pdb进行重命名 alter session set container=pdblhr3; select * from global_name; alter pluggable database...pdblhr3 rename global_name to pdbprod3; -- 步骤3、正常关闭和启动pdb alter pluggable database close immediate;...to JDEPROD; alter pluggable database close immediate; alter pluggable database open; 注意事项 1、必须进入目标PDB

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pdb data structure format

In a nutshell here’s how the PDB looks like - Stream No....Contents Short Description 1 Pdb (header) Version information, and information to connect this PDB to...https://github.com/microsoft/microsoft-pdb #pragma once #define _CRT_SECURE_NO_WARNINGS #include <windows.h...{ public: // // Default constructor. // PDB(); // // Instantiates PDB class with particular...PDB file. // PDB( IN const CHAR* Path ); // // Destructor. // ~PDB(); // //

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Python学习 Day 12 调试断言 logging pdb pdb.set_trace()

)() -> s = '0' 以参数-m pdb启动后，pdb定位到下一步要执行的代码-> s = '0'。.../sicp/err.py(4)() -> print 10 / n 任何时候都可以输入命令p 变量名来查看变量： (Pdb) p s '0' (Pdb) p n 0 输入命令q结束调试，...(4)() -> print 10 / n (Pdb) q Try 这种通过pdb在命令行调试的方法理论上是万能的，但实在是太麻烦 pdb.set_trace() 这个方法也是用pdb，...但是不需要单步执行，我们只需要import pdb，然后，在可能出错的地方放一个pdb.set_trace()，就可以设置一个断点： # err.py import pdb s = '0' n = int...(s) pdb.set_trace() # 运行到这里会自动暂停 print10 / n 运行代码，程序会自动在pdb.set_trace()暂停并进入pdb调试环境，可以用命令p查看变量，或者用命令c

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python的pdb模块

pdb模块是python自带一个调试模块，在没有pycharm的iIDE环境情况下，最佳调试方式就是使用pdb模块调试。...一、介绍pdb调试环境的常用命令命令备注ll 或 l查看全部代码n执行下一行代码c执行全部代码b 行数某行打断点，程序运行到断点处会停下clear清除断点s也是一行一行执行代码，但可以进入函数内部执行s...函数名直接跳到具体某个函数内部执行r快速执行到函数最后一行p打印某一个变量的值a打印所有形参的数值q退出调试环境二、pdb调试使用1、一个py文件的调试执行py文件并进入调试 python -m pdb...2、一个项目的调试一个项目代码庞大，像上面调试就显得吃力，不过，我们可以在代码植入pdb的方法，认为容易出错的地方，进入pdb调试导入pdb模块 import pdb pdb.set_trace()...官方文档：https://docs.python.org/3.6/library/pdb.html

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BioPython-PDB-1

实例：直接用它来处理结构文件 #读取结构文件 #(1)读取mmcif文件 #创建一个mmcif解析器 from Bio.PDB.MMCIFParser import MMCIFParser parser...= MMCIFParser() #导入mmcif结构文件 structure = parser.get_structure('1fat', '1fat.cif') #（2）读取pdb格式文件 #创建一个...pdb解析器 from Bio.PDB.PDBParser import PDBParser p = PDBParser() #导入pdb文件 structure = p.get_structure('...1d3z','1D3Z.pdb') #这样就拿到了蛋白结构 #看下结构的表示 #一个 Structure 对象的整体布局遵循称为SMCRA（Structure/Model/Chain/Residue

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记录一次Oracle 19.11使用PDB Refresh方式迁移PDB

近期在某银行生产环境做的一次PDB迁移，使用的是PDB refresh方式，记录一下流程及遇到的坑。...DG相较于PDB refresh配置更麻烦 PDB refresh的前置条件比DG多停机时间来看，DG略短于PDB refresh 最后还是定的使用PDB refresh，主要是因为没在生产上做过，积累下经验...，另外也简单：）三、什么是PDB Refresh 简单来说：创建目标端到源端的DBlink，目标端create pluggable database，指向源端PDB，这样就将源端PDB copy过来，...注意： PDB Refresh支持三种类型的源端数据库，分别是 Local PDB/PDB in a remote CDB/Non-CDB PDB Refresh不支持跨平台、不支持跨大版本四、迁移流程...六、小结条件合适的情况下，使用PDB Refresh方式迁移PDB简单快捷，但是目前感觉坑多一点。

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登录连接 CDB 和 PDB

alter session set container=pdb1; SYS@cdb1> show con_name 方法二:使用服务名连接查看 pdb1 服务名 SYS@cdb1> select...[oracle@orcl19c ~]$ sqlplus sys/oracle@pdb1 as sysdba SYS@pdb1> show con_name SYS@pdb1> show pdbs cdb...使用 connect 命令切换到 pdb 查看当前容器 SYS@cdb1> show pdbs sqlplus 中使用 connect 命令直接切换到 pdb1 SYS@cdb1> conn sys/...oracle@pdb1 as sysdba SYS@pdb1> show pdbs 1.7 pdb 切换回 cdb 1.7.1 方法一:alter session set container SYS@pdb1...> alter session set container=cdb$root; SYS@pdb1> show pdbs 建议通过服务名的方式切换或连接 SYS@pdb1> conn sys/oracle

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pdb--python调试利器

一、调试模块 >>> import pdb >>> import mymodule >>> pdb.run('mymodule.test()') >(0)?...() (Pdb) continue >(1)?() (Pdb) continue NameError: 'spam' >(1)?...() (Pdb) 二、调试脚本 python3 -m pdb myscript.py 三、代码中打堆栈(3.7版本内置了该功能) import pdb; pdb.set_trace() 四、查看crashed.../mymodule.py(3)test2() -> print(spam) (Pdb) 五、主要函数六、实现自定义功能可以修改pdb.Pdb类 class pdb.Pdb(completekey='...tab', stdin=None, stdout=None, skip=None, nosigint=False, readrc=True) eg：跳过特定模块 import pdb; pdb.Pdb

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未加载mscorlib.pdb

前言：　　早上上班按照正常流程打开Visual Studio，调试本地项目，然后奇怪的是一直提示未加载mscorlib.pdb，导致项目无法正常运行，经过一番折腾最后解决了这个突如其来的bug！

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VisualStudio 2019 调试项目使用 Portable PDB 提示不支持 PDB 格式

在新的 .NET 上，将会默认使用 Portable PDB 符号格式，而如果 VisualStudio 配置了使用托管兼容模式，那么将在加载符号的时候，将会提示不支持 PDB 格式在发现自己的代码因为没有加载符号而断点无法命中提示当前不会命中断点...此时的 VS 将因为默认不会忽略 pdb 符号文件时间戳而失败在自己找 PDB 文件，将会提示不支持 PDB 格式，或者英文版本的 PDB format is not supported 提示解决的方法不是让...VisualStudio 2019 忽略 PDB 文件校验，而是通过配置的方法禁用使用托管兼容模式。...只有在将默认调试引擎替换为旧版本才需要使用托管兼容模式，而旧版本的调试不支持新版本的 PDB 格式点击工具->选项->调试找到使用托管兼容模式选项，禁用即可在英文版本的 VS 对应的选项是 Use...Managed Compatibility Mode 选项更多关于使用托管兼容模式的功能，请看使用托管兼容模式官方文档 “PDB format is not supported” with .

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