<- "Valproic+acid|Valproate[Title/Abstract]+ALDH5A1[Title/Abstract]"EUtilsGet(r, db= "pubmed")你对这种行为有什么想法或解释吗？将被丢弃，尽管它经常列在数据库中。
浏览 12提问于2015-10-07得票数 1
我想生成一个数据帧，如下所示；
ids <- map(pmiddata[,"Query"],get_pubmed_ids)
for (i in 1:length(ids)) {pmiddata[i,"Resu
浏览 2提问于2018-03-02得票数 0
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我已经用lxml.etree用Python编写了一个解析器，现在我正试图在Hadoop集群上运行上述解析器。当我在本地运行该函数时，它按预期工作，但当我尝试将其应用到集群上的文件时，我会收到以下错误(我正在Pyspark，python3中执行以下操作)xml_tree = etree.parse(xml_pathname)
OSError: Error reading file '/file_path/date_directory/exa
浏览 3提问于2020-04-08得票数 0
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将页码传递给Pubmed
、、、
我正在做一个从pubmed检索记录的项目，它的工作很好，问题是我需要通过url精确地从pubmed中检索对应于某个术语的页码。例如， //或者像这样的smthg！
请帮帮我！
浏览 0提问于2011-09-07得票数 0
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我刚刚发现了一个用于R的包，它可以从pubmed中检索摘要，非常棒。但在数据检索过程中，我一直收到警告消息：[1] 82
我在pubmed上手动搜索，找到了相同数量的文章(
浏览 0提问于2011-08-08得票数 2
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我使用BioPython通过eutils API查询Pubmed数据库。esearch端点有一个排序选项，但是API文档没有列出这个值的所有选项。示例呼叫： sortsort_method工作的值
但是，我不知道如何指定默认的排序
浏览 4提问于2015-11-21得票数 4
所以我试着从NCBI检索一些数据。= record1.get("IdList") print("Plant: {} Disease: {} PubmedID: DOI:".format(plant, disease)) handle2 = Entrez.esumm
浏览 26提问于2020-02-28得票数 0
我已经使用DB浏览器创建了一个数据库，我想把我从PubMed得到的所有研究结果放到数据库中，包括标题和文章，我可以把它们拿出来，但当我把它们输入到数据库中时，我总是出错。import PubMedLookupimport sqlite3 email= 'litsunchak@gmail.com'
url = 'http://ww
浏览 0提问于2020-10-07得票数 0
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我的任务是使用NCBI的E-Utilties检索过去10年中每年提交的关于Crispr/Cas9系统的论文数量。我如何一次搜索多个数据库？到目前为止我的代码如下：
handle = Entrez.esearch(db ="pubmedrecord["Count"]
print "Number of papers in 2016 is: ", r
浏览 1提问于2016-05-10得票数 0
我的数据库中有两个表：ID pubmed_ID1 22test2看起来像这样：Hello 22当我使用以下select语句时： from test1, test2 我得到了：
ID pubmed
浏览 0提问于2010-07-12得票数 0
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一段时间以来，我一直试图用它的标题来获取Pubmed摘要。对于istance，如果我将以下标题放在pubmPd掩码@ 上：
A垂体源性MEG3亚型在肿瘤细胞中起抑制生长的作用。
浏览 10提问于2022-03-20得票数 0
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我正在尝试创建一个与pubmed api交互的函数，以检索与100个出版物相关的xml文件。然后，我想逐个解析xml文件，以检索每个出版物的标题和摘要。我正在使用Rentrez包与api进行交互，并且已经成功地检索到了必要的xml文件。我正在使用xml包解析xml文件，并且已经验证了Xpath表达式是否检索到了我想要的数据。我在运行我的代码时收到以下错误：当我测试接收标题信息的函数时(通过删除
浏览 0提问于2016-12-03得票数 0
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GENERALRequest URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed%222015%22%5BDate%20-%20Publication%5D%20%3A%20%223000%22%5BDate%20-%20Publication%5D;id=reldata:db=pubmedfrom urllib.parse import urljoin
from bs4 import
浏览 0提问于2018-06-29得票数 9
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守则的有关部分： 'term' : val,'EntrezSystem2.PEntrez.PubMed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_DisplayBar.sPageSize' :
浏览 1提问于2015-02-14得票数 1
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我试图使用PMID列表查询PubMed，并试图为每一篇文章(如发布类型)提供一些信息。我希望最终创建一个由2列组成的数据框架:一个列列出PMID，另一个列列出发布类型。library(tidyverse) library(regexr) library(XML)
batches<-
浏览 4提问于2017-05-16得票数 0
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我得到了PubMed的文章，我使用Power来可视化每个作者写了多少篇文章，每一篇文章都是由许多作者写的，如图中所示--这是我在power bi中的表结构。
浏览 2提问于2021-06-17得票数 0
format = "bibliometrix") 在数据帧'dfa‘的从属关系列'C1’或'AF_UN‘中，我们可以观察到，例如，对于第2行和第3行(PMID 34044912和34044911)，虽然在相应的Pubmedhttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34044912/ https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34044911/ 如何检索
浏览 21提问于2021-06-27得票数 0
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我想下载所有的公共数据摘要。有谁知道我如何轻松地下载所有的公共文章摘要吗？有没有下载所有这些tar文件..。
浏览 6提问于2015-11-04得票数 7
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下面是我使用的方法： nih_pub = NihPublication.where(user: current_user).all pubmed_pub.each {|pubmed|
if nih.pubyear ==pubmed.publication_year and nih.pmid == pubmed
浏览 3提问于2016-05-11得票数 0
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2回答
我想传递一个条件，if(xmlName(fetch.pubmed) == PubmedBookArticle提取某些值，elseif (xmlName(fetch.pubmed) == PubmedArticle这看起来很简单，但是(xmlName(fetch.pubmed)抛出错误no applicable method for 'xmlName' applied to an object of class<- entrez_fetch(db = "pubmed", id =
浏览 2提问于2015-11-02得票数 0
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