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    python实战:学习生信大牛Sarah A. Teichmann发在Science上的单细胞分析

    python也学了一段时间了,现在找一下教程做一些代码训练实战,今天分享的就是来自2020年2月21号发表在Science杂志上的一个资源,文献标题为《A cell atlas of human thymic...以前也有一篇完整的python版本实战: Python图文复现2022|01-文献阅读:致命COVID-19分子单细胞肺图谱 Python图文复现2022|02-数据介绍与下载 Python图文复现2022...|03-多样本整合分析 Python图文复现2022|04-绘制单细胞文献Figure 1 Python图文复现2022|05-绘制单细胞差异分析热图 Python图文复现2022|06-单细胞功能富集分析...进一步将它们分类为亚型,包括胸腺上皮细胞(TECs)、成纤维细胞、血管平滑肌细胞(VSMCs)、内皮细胞和淋巴内皮细胞(图1E)。...成纤维细胞2型(Fb2)细胞(标志基因PI16、FN1、FBN1)(图1E)。相比之下,调节血管发育的细胞外基质(ECM)基因和sema基因则特异性地在Fb2中被检测到(图S3A)。

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    从二进制到HelloWorld

    复杂指令集就相当于C++,写起来比较麻烦但是效率很高,在个人电脑上用的比较多,精简指令集相当于是python,写起来和方便,但是效率比较低,现在手机上一般都用的是Arm的指令集。...19: 48 83 c4 30 add $0x30,%rsp 1d: 5d pop %rbp 1e... 1a: 83 45 fc 01 addl $0x1,-0x4(%rbp) 1e: b8 00 00 00...28: c3 retq 第7行的代码先对 x 和 9 进行了比较,把比较结果存起来,然后第八行上面的结果进行判断,大于 greater 的化就跳转到 1e...现在,编译器帮助我们生成机器码,我们使用 C 、C++ 和 Python 这样的高级语言,虽然不用直接接触到这些机器码,不过这些内容对代码调试、理解栈溢出、代码执行的效率等等都比较关键。

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    斯坦福CS231n - CNN for Visual Recognition(7)-lecture6梯度检查、参数更新

    对于相对误差而言: 相对误差>1e−2相对误差>1e^{−2} :意味着解析梯度计算出错 1e−2>相对误差>1e−41e^{−2>}相对误差>1e^{−4}:解析梯度可能出错 1e−4>相对误差1^{...所以如果你是对10层神经网络做梯度检查,那么1e−21e^{-2}就没啥问题,因为误差一直在累积。相反,如果一个可微函数的相对误差值是1e−21e^{-2},那么通常说明解析题都出错了。...通常会将解析梯度和数值梯度显示出来,以保证计算时,所有的数都在浮点数的可计算范围内,如果太小(1e−101e^{-10})可考虑乘个常数。 目标函数的不可导点(kinks)。...考虑当x=1e−6x=1e^{-6}时,对ReLU函数进行梯度检查。因为x=1e−61e^{-6}1e−4或1e−61e^{-4}或1e^{-6},梯度检查可能就恢复正常。

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