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使用R语言绘制SCI插图云雨图

云雨图介绍 我们使用r语言中ggplot2包绘制云雨图,云雨图可以看做是核密度估计曲线图、箱线图和抖动散点图的组合图表。...我们可以使用自定义的半小提琴函数geom_flat_volin()、箱型图函数geom_boxplot和抖动散点图函数geom_jitter()叠加实现。...2.代码复刻 2.1准备数据 这是我们本次数据部分截图 2.2打开Rstudio设置工作路径和导包并且导入数据 setwd('你的工作路径') #导包 library(ggplot2) #导入数据...data <- read.csv('data1.csv') 2.3 ggplot2库实现图形绘制 2.3.1绘制半提琴图 2.3.2绘制抖动散点图 2.3.3叠加箱线图 2.3.4实现坐标翻转...,与海盗图相比,它显得没那么冗余;与小提琴图相比,它又在核密度估计曲线图的同时,加上了抖动散点图。

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振动耐久试验——正弦叠加随机

图1 视频1 02 — 正弦叠加随机——频域 图2 展示了正弦扫频(Sine Sweep)和宽频随机(Random)信号频域上的PSD(功率谱密度)图。 视频2是试验的一段过程。...扫频曲线,即通过图2右下图的峰值并不能算出图2右上图的峰值。因为正弦扫频频谱代表当前扫频的频谱,而正弦叠加随机的PSD谱代表的是平均后的谱线。...图3 03 — 为什么要用正弦叠加随机 图4 和视频3,是正弦叠加随机信号在频域上的瀑布图(为了方便凸显随机信号,特意将01前言部分随机信号放大了3倍,即PSD放大了9倍)。...如果没有叠加随机信号的话,瀑布图在正弦扫频频率范围(100~400Hz)外的能量是0,而对产品的实际振动环境测量结果(图5)在高频部分是有能量的。 ?...图4 视频3 所以,用正弦叠加随机来对产品进行振动考核,是为了更真实的反映产品受到振动激励。见图4右上图和图5的对比(注意视频3最后鼠标所指的位置)。

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    ChIP-Seq 分析流程-下游 (1)

    这一步在Rstudio中完成,Rstudio中如何创建文件和移动文件就不多说了,网上说的很详细了,这里直接展示成品号,哈哈哈哈。...对于弱信号的数据集,读取长度峰将开始占主导地位。 无信号 一次失败的实验会类似于仅使用输入数据的交叉相关图,在这种情况下,我们几乎观察不到片段长度的峰值或根本没有峰值。...DiffBind 包含支持处理峰值集的函数,包括在整个数据集中重叠和合并峰值集、在峰值集中重叠的区间中计数测序读数、以及基于结合亲和力(通过读数密度差异测量)的证据识别统计学上显著的差异结合位点。...密度图和热图 由于许多顺式调控元件靠近其靶标的 TSS,因此一种常见的可视化技术是使用 bigWig 文件来获得 TSS 周围富集的全局评估。...matrixNanog_TSS.gz \ -p 6 \ --outFileSortedRegions results/visualization/regionsNanog_TSS.bed 接着根据这个中间文件创建一个密度图

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    停课不停学!深圳罗湖联手腾讯教育打造多元化防疫解决方案

    图:罗湖区教科院2020年新学期教研工作会 一校一方案:打造多元教育防疫解决方案 近年来,深圳罗湖扎实推进教育信息化建设,将智慧教育云平台、教育管理信息化纳入“智慧城区”建设中,形成全区一盘棋统筹布局。...这份从容来源于平日的积累:早在去年9月,腾讯教育即与罗湖联手,助力区智慧教育云平台的整合,并建立了统一用户身份认证、统一开放接口管理、统一云资源服务和统一生态资源,为罗湖教育主管部门、学校、教师、学生、...针对此次疫情,罗湖区积极尝试教与学方式的转变,探索在线教育教学的新方式。提出“一校一方案”,确保延迟开学期间的在线教育实施有计划、有组织、有秩序、有效果。...此次,翠园初级中学选用了腾讯课堂极速版,首日的在线人数峰值达2290多,且全程画面声音流畅,备受学生和家长们的肯定。...图:罗湖区翠园初级中学周小荣校长9:00举行了全校师生的开学典礼 腾讯课堂极速版,是为了契合疫情期间师生们在线教学的需求而特别推出的。

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    R语言之基础绘图

    我们还可以在一幅直方图上添加一条密度曲线和轴须图。此时,需要在函数 hist( )里面设定参数 freq 为 FALSE,即把纵坐标换成频率,否则将会几乎看不到密度曲线。...col = "red", xlab = "体重(lbs)", main = "治疗前体重分布直方图", las = 1) # 然后使用函数 lines( )在直方图上叠加了一条蓝色的...小提琴图(violin plot)可以看作是箱线图和密度图的结合。vioplot 包里的函数 vioplot( )可用于绘制小提琴图,使用前请先安装并加载该包。...在 RStudio 右下方的“Plots”下,单击“Export”,选择“Save as Image”或“Save as PDF”,可以把图形保存在指定的文件夹下。...需要注意的是,这种方式保存的图形与 RStudio 图形窗口的尺寸有关,即不同大小的窗口得出的图形会有差异(在 ModelWhale 中,可以右键单击图片,直接另存为)。

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    Python中概率累计分布函数(CDF)分析

    PDF、CDF、CCDF图的区别 PDF:连续型随机变量的概率密度函数是一个描述这个随机变量的输出值,在某个确定的取值点附近的可能性的函数。...概率密度函数,描述可能性的变化情况,比如正态分布密度函数,给定一个值, 判断这个值在该正态分布中所在的位置后, 获得其他数据高于该值或低于该值的比例。...CDF:能完整描述一个实数随机变量x的概率分布,是概率密度函数的积分。随机变量小于或者等于某个数值的概率P(X密度函数PDF→ 图中阴影面积=随机选择一个小于x的值的概率=总体中小于x的所有值所占比例 上面的pdf描述了CDF的变化趋势,即曲线的斜率。...'VALS']/denominator # #将列表列索引重命名 Fre_df.columns=['Rds','Fre'] # # 将数据列表从小到大排列,然后将每个数据出现的概率进行叠加

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    从DBSCAN算法谈谈聚类算法

    密度可达的关系相对弱一点,除A点邻域内的其他红色点与A的关系均属于密度可达。 5. 个人觉得密度相连与密度可达是一个概念,只是说考虑的角度不同,从A出发,能够密度可达的任意两个点都属于密度相连。...A校学生的平均分集中在70分,而B校学生的成绩集中在90分,并且分别向两边扩散,且分布密度逐渐递减。在83分这个边界上两者有所交叉。...如A校,B校问题,在历史进程中,A校,B校在招人时,就有一种自然规则,中考成绩优异的进入B校,而中考稍差的进入A校。这种历史因素我们虽然观测不到,却着实影响了未来成绩的分布情况。...这张图很好的解释了类的群聚效应,虽然每个学生是独特的,但由于他们先天的资质和后天的努力在一个类群中相差不多,导致做数学题时,每个群体对于不同难度的题的回答准确率不同,可在群体内正确率是相近的。...同样的当ϵ=5\epsilon = 5和MinPts =3,得到如下分类图: ? 降低邻域内的样点数同样能导致分类失败。

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    使用R语言ggplot2包绘制SCI论文配图密度散点图

    最近有一位小伙伴要发SCI论文,给我发了3w多条数据,问我可不可以画和下图基本相似的图。大家都知道论文的发表除了实验和数据以外,图片也非常重要。一般图画的越好,那么论文发表的问题也不大。...我仔细想了一下自身的实力,觉得可以试一下。那么下面我就用所学R知识不多的情况下教大家绘制这幅SCI配图。 本次绘图工具:RStudio。...RStudio是R的集成开发环境,界面更加丰富实用,使用起来更加方便。...ggpointdensity是这次绘制密度散点图的包。...知乎的这篇文章:https://zhuanlan.zhihu.com/p/109468400,详细介绍了R和Rstudio的安装,大家可以参考一下。 接下来打开RStudio来完成这幅图的绘制。

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    学习小组笔记Day4-蘑菇

    1.R和Rstudio的安装见百度网盘2.关于R和RstudioR是一种编程语言,汇集了许多函数,RStudio是免费提供的开源集成开发环境(IDE)。...RStudio提供了一个具有很多功能的环境,使R更容易使用,是在终端中使用R的绝佳选择。...---生信星球公众号图片众号3.尝试作图plot(rnorm(50))图片plot:R有强大的绘图功能,plot()函数是一种常用的绘图函数,用其可以绘制散点> >图、曲线图等。..."h":绘制出点到横坐标轴的垂直线;"s":绘制出阶梯图(先横后纵);"S":绘制出阶梯图(先纵后竖);"n":作空图。...rnorm() 函数会随机正态分布,然后随机抽样 或者取值 n 次r 这列代表随机,可以替换成dnorm, pnorm, qnorm 作不同计算r = random = 随机, d= density = 密度

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    基于ENVI的Landsat 7影像处理与多种大气校正方法对比

    在我们所获得的遥感影像原始数据中,每一个像素对应的像元值往往是未经明确量化、没有统一量纲的数据(DN值,即Digital Number);而当我们需要利用遥感影像的信息对地物属性进行分析时,则往往需要其辐射亮度值...由图可知,QUAC快速大气校正与FLAASH大气校正所得结果为辐射率数据,数据往往在1500至2000部分;而简化黑暗像元法大气校正和波段合成后未经大气校正的结果数值则多处于80以下。...可以看到,辐射图像在0.7至0.8附近上升快速,并在0.9左右形成一个峰值;随后曲线趋势较为平缓,达到1.5至1.6附近再次迎来一个峰值,随后明显下降。...这同样较为符合植物反射的规律,即在绿色光0.5附近吸收率较高,反射率低;在可见光波段0.4至0.76处有一个反射峰值,而在近红外波段0.7至0.8处有一反射陡坡;且在1.0至1.1附近有一峰值。...从这些图对比依然可以发现之前得到的结论,即未经大气校正的结果与简化黑暗像元法大气校正结果十分类似,二者之间的差异很不明显;QUAC快速大气校正与FLAASH大气校正所得结果与未经大气校正的结果差异明显,

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    Nature子刊:EEG源成像可检测到皮层下电生理活动

    图1 OCD患者的电极植入和电生理记录。 a)术后CT扫描与MRI的叠加,说明颅内DBS电极在其与内囊的过渡处的位置,显示为蓝点(即伏隔核)。...c)使用头皮EEG的PSD和颅内记录来选择单个的alpha峰值频率(左图)。窄带滤波后的alpha包络显示了头皮和颅内信号的相似性和差异性(右图)。...过滤头皮电极和颅内电极信号在±1Hz之间的单个Alpha峰值(图1b,补充图2),使用Welch’s method进行功率谱密度(PSD)分析。然后,使用Hilbert变换计算解析信号。...通过将负相关值设置为零来忽略它们,因为它们可能源自分析中的阈值化步骤。所有分析均使用Cartool工具和自定义编写的MATLAB脚本执行。 ? 补充图2.每个受试者的头皮脑电和颅内记录的功率谱密度图。...一名被试在颅内部位未见alpha峰值。由于明确的频谱峰值是研究神经振荡的可检测性的前提,因此该受试者被排除在进一步分析之外。

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    【AIDL专栏】方以类聚,物以群分,吉凶生矣 | 于剑:聚类理论与算法选讲

    依据概率理论的,依据信息论的,依据图论的(如谱聚类),依据模糊论的,依据博弈论的,量子力学的等等。理论的不统一导致研究聚类算法的复杂性。...无参密度估计聚类方法 当不知道数据分布的任何先验时用无参估计。此时,类认知表示定义为密度峰值的对应点。 1993年提出的削峰聚类法是第一个此类算法。...削峰聚类法先计算出当前密度函数的最大峰值,通过削去最大峰值来修改当前密度函数,得到新的密度函数,重复上述步骤,直到得到足够多的聚类中心。 削峰聚类法主要用来找出聚类中心。...图6 描峰聚类算法 如上右图,从其可视化图中可以得到10号和1号小圆是密度最高的点,是合适的聚类中心。 4、小结 本节主要论述了几种典型的聚类算法。...对于聚类算法,类表示创新是最重要的创新,本文中只有涉及类表示研究的部分算法,其他算法读者可以阅读论文自行学习。 五、 聚类有效性研究 虽然没有统一的聚类评价标准,但聚类评估函数遵循上述的归类公理。

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    2017年腾讯公司创新创业联合基金项目申报指南(第二批)

    ;有能力的学校可以开发基于微信校园卡的线下应用,比如微信刷门禁、校园微信支付等应用场景,腾讯可提供技术支持; • 开发基于微信平台的校园服务小程序:利用腾讯微校提供的校园微信小程序自助服务平台,开发校园服务小程序...微校校园微信小程序自助服务平台相关指引文档可登陆微校应用中心开放平台(open.weixiao.qq.com)查询; • 项目建设周期为6个月,项目结束之前,提交所要求的开发成果; • 项目建设过程中产生的各种成果...“A”或“A+”评分的开发团队所在学校,腾讯微校将为学校颁发优秀组织奖,为项目申报时填写的指导老师颁发优秀指导老师奖。...如有疑问,请致电0755-86013388-85646,关能辉; • 评审:评审专家组对申报方案进行统一评审,确定立项项目以及相关支持方案;项目经双方确认后,签署合作协议;项目合作期为6个月; • 运营...:基于腾讯微校平台研发完成的项目上架到腾讯微校平台后,校方团队可策划市场推广方案,腾讯公司根据方案要求提供一定的运营支持,共同运营; • 结项:项目完成后,项目负责人提交《项目验收报告》,由专家组审核项目成果并颁发结题证书

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    深入剖析Mean Shift聚类算法原理

    Mean Shift(均值漂移)是基于密度的非参数聚类算法,其算法思想是假设不同簇类的数据集符合不同的概率密度分布,找到任一样本点密度增大的最快方向(最快方向的含义就是Mean Shift),样本密度高的区域对应于该分布的最大值...其中虚线表示每个样本点的高斯核,实线表示累加所有样本高斯核后的数据集密度。因此,我们通过高斯核来得到数据集的密度。...上节介绍了通过引入高斯核可以知道数据集的密度,梯度是函数增加最快的方向,因此,数据集密度的梯度方向就是密度增加最快的方向。 由上节可知,数据集密度: ? 上式的梯度为: ? 其中 ?...如下图是一维数据集的核概率密度,其中虚线表示每个样本的核函数,实线是每个样本的核函数进行叠加,表示数据集的概率密度。...每个样本点最终会移动到核概率密度的峰值,移动到相同峰值的样本点属于同一种颜色,下图给出图像分割结果: ?

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    振动试验规范对比——其他

    对于正弦扫频、宽频随机、正弦叠加随机,都可以用频响函数来计算相对位移响应。 图8右下图,是在正弦加速度激励下,结构(fn=200Hz,Zeta=0.05)的相对位移响应。 ?...图8 图9右下图,是在宽频随机激励下,结构(fn=200Hz,Zeta=0.05)的相对位移响应。 ? 图9 对于正弦叠加随机:可以理解为图8和图9的加和。因为很难画,这里就不再画图描述 。...统计60s 相对位移时域信号的过零点峰值数,将该峰值数延拓到8h(即乘以480倍)。...图11是对一个时域信号的过零点峰值统计举例:首先统计了0.5s的数据,如果想要延拓到1.5s,只要对统计的数据*3即可,如图11右上图红色虚线。 ?...详细内容,请参考LMS 李旭东博士的公众号“耐久论坛”。 ? 图12 06 — 试验对比方法总结 不论是过零点峰值统计还是雨流计数,得到的都是幅值和循环次数的关系曲线。

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    研究了每日优鲜和叮咚买菜后,我总结出生鲜电商的两个盈利模型和盈利公式

    2019年生鲜电商渗透率仅为6.3%,随着技术的更迭和消费者线上购买生鲜的习惯培养,以及此次疫情的叠加影响,生鲜电商的渗透率有望加速上行。...生鲜电商密度模型图 1、供应链密度:SKU密度、生产商密度和买手密度 SKU(库存量单位)密度:在生鲜电商领域,最关键的其实并不是精选,而是精选之后的采购能力。...升级之后前置仓订单量大幅增长,日订单峰值为2000单,年坪效达到 10-12 万,是传统线下门店的5-6 倍。...生鲜实体店“店仓”业务流程图 3、用户密度:高频次、高留存、高社交。 每日优鲜由于有腾讯智慧零售的助力,以社交关系链的方式,结合高频度的生鲜品类消费,在用户密度上远远超越了多数的竞争对手。...根据Ocado的平均周订单和周订单峰值的数据分析,后台物流产能利用率从2013年的68.1%提升至2015年的81.25%是其能够实现盈利的关键。

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    「指甲盖」上集成500亿晶体管!全球首款2nm芯片制程发布,未来手机四天一充电?

    然而,随着FinFET和其他3D晶体管设计的出现,现在的工艺节点名称是对「等效2D晶体管」设计的解释。一般用晶体管密度可以更准确的衡量,如同英特尔倡导的那样。...通过下表可以获得更好的比较: 不同的代工厂有不同的官方名称,有各种密度。...值得注意的是,这些密度数字通常被列为峰值密度,用于晶体管库,其中芯片面积是峰值关注点,而不是频率扩展--由于功率和热方面的考虑,通常处理器最快的部分的密度是这些数字的一半 关于向全方位门/纳米片晶体管的发展...IBM 2纳米硅制造工艺的剖面图:叠加式GAA(Stacked GAA ,其中GAA是「切入环绕式栅极技术」的简称) 此前,三星在3纳米时引入GAA,而台积电则要等到2纳米。...但是必须承认,英特尔的芯片在相同的纳米数字上往往比竞争对手有更大的晶体管密度。

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    北京大学团队:“神经卷轴”探针助力非人灵长类动物全脑尺度记录 | Nature子刊

    例如,1024个位点可以分布在杆长度的高密度簇中,以针对特定的大脑区域,或者沿整个杆长度均匀分布(图1e)。这种灵活性允许Neuroscroll探针适应对大脑中特定生物系统进行研究的定制需求。...h: 探针1上所有分类的单个单元在恒河猴不同大脑结构中的效率、密度和扩散情况,通过箱线图展示,并叠加原始数据点。i: 单个神经元信号质量的量化,通过带有原始数据点叠加的箱线图表示。...这些白质区域中的SUAs密度和幅度明显高于其它脑结构采样到的SUAs,并且它们的波形形状也非常独特(图4a-f)。...d: 神经元位置(x轴)与振幅(y轴)的散点图,通过核密度估计(KDE)沿x和y轴显示不同类型波形的空间分布和振幅分布情况。e: 顶图为波形示例,标注了三个主要偏转(首峰、波谷和峰值)。...底图为spike波形分类的流程图。f: 探针2在不同大脑结构中解析的所有单个神经单元的效率、密度和分布情况的箱形图。

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    振动耐久试验——宽频随机

    真正的随机信号应该是幅值随机,相位也随机。 对比图1和图2,可以看出,同样是由4个频率正弦/余弦信号叠加而成的信号,不同频率虽然幅值相同,但由于初始相位不同,所以叠加出来的时域信号是完全不同的。 ?...图1 ? 图2 这是我们认识振动台上宽频随机信号的基础。 02 — 随机信号的生成 已知功率谱密度曲线PSD,即图3中红色圆圈连线。...相当于将图1或图2的频率取得更密一点。 4. 叠加各频率下的正弦/余弦信号。 得到的随机信号如动图6,图7 ? 图6 ?...图10 04 — 随机信号的概率密度 如果随机信号的初始相位没有经过刻意设计,那么其概率密度曲线即为均值为μ=0,标准差σ=RMS的正态分布,如图11。 ?...图12 以上,是对振动耐久试验中宽频随机的简单介绍,后面将介绍一下正弦叠加随机。

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