凑齐六个字吧

文章/答案/技术大牛

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LV5

发表了文章 12天前2025-06-16 17:01:36

单细胞数据的差异分析及火山图绘制(Python)

既往内容基于Python绘制了纵向、横向和比例条形图(柱状图)：https://mp.weixin.qq.com/s/n_JCFlg0_FaoQJEmrrWu9...

凑齐六个字吧 12天前2025-06-16 17:01:36

数据挖掘

发表了文章 16天前2025-06-13 08:00:59

复杂多样本10X单细胞数据整理及读取流程(Python)

既往整理过R语言版本的读取流程：常见不同单细胞数据类型的读取及Seurat对象创建方法整理(单多样本/10X/h5/txt/csv/tsv)，https://m...

凑齐六个字吧 16天前2025-06-13 08:00:59

数据挖掘

发表了文章 17天前2025-06-12 10:26:13

GEO数据库中单细胞数据下载中断或太慢？多种下载/提速方法汇总

在GEO网站上直接点击下载数据时，可能会遇到下载中断或速度过慢的问题，此时可以尝试以下几种替代方法来获取数据。

凑齐六个字吧 17天前2025-06-12 10:26:13

数据挖掘

发表了文章 18天前2025-06-11 10:43:45

Minifoge安装及其使用学习(Mac/Apple Silicon ARM64 架构)

最近尝试了很多基于Python的训练，但是在管理各种库的时候经常会遇到跟自身电脑架构(Apple Silicon ARM64 架构)不一致导致的不兼容安装困难的...

凑齐六个字吧 18天前2025-06-11 10:43:44

数据挖掘

发表了文章 18天前2025-06-10 20:37:39

单细胞数据的纵向、横向和比例条形图(柱状图)绘制(Python)

在R语言中有个强大的R包ggplot2，它能够帮助我们完成很多绘图工作，方便又好用。Python环境中用于绘图可能会比较常用mamatplotlib，seabo...

凑齐六个字吧 18天前2025-06-10 20:37:39

数据挖掘

发表了文章 19天前2025-06-09 21:28:28

单细胞CellBender去除环境RNA污染学习(Python)

CellBender用于从高通量单细胞组学数据中消除技术伪影，包括scRNA-seq、snRNA-seq和CITE-seq。

凑齐六个字吧 19天前2025-06-09 21:28:28

数据挖掘

发表了文章 23天前2025-06-06 00:59:04

CEL结尾的芯片数据处理方法(oligo和affy)学习

oligo和affy这两个包都能够处理CEL结尾的芯片数据，但是适用性存在一定的差别。让大模型帮忙整理了一下。

凑齐六个字吧 23天前2025-06-06 00:59:04

数据挖掘

发表了文章 27天前2025-06-01 16:19:32

Scanpy分析全流程(含harmonypy整合/细胞周期矫正/双细胞检测及去除)

本次走一遍Scanpy全流程，数据集仍为GSE188711，该数据集可至GEO官网下载。

凑齐六个字吧 27天前2025-06-01 16:19:32

数据挖掘

发表了文章 2025-05-192025-05-19 07:50:35

Seurat和h5ad数据相互转化以及10X多样本数据整理和读取(Python)

目前已完成基于R语言的单细胞分析实战系列，涵盖初级、中级和高级三个阶段（每个阶段暂时各包含4篇内容，后续将陆续更新）。接下来，将尝试开展基于Python的单细胞...

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数据挖掘

发表了文章 2025-05-152025-05-15 09:40:20

数据下载工具-aria2c学习

aria2 是一个用于下载文件的工具。它支持的协议包括 HTTP(S)、FTP、SFTP、BitTorrent 和 Metalink。aria2可以从多个来源和...

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数据分析

发表了文章 2025-05-122025-05-12 07:48:26

单细胞实战之单细胞非负矩阵分解(cNMF)——入门到进阶(高级篇4）

接下来将回顾学习非负矩阵分解这个工具, 单细胞实战之单细胞hdWGCNA分析——入门到进阶(高级篇3）:https://mp.weixin.qq.com/s/K...

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数据挖掘

发表了文章 2025-05-102025-05-10 16:30:18

单细胞RNA速率(velocyto)分析学习(二)

RNA速率分析（RNA velocity）旨在通过分析细胞内mRNA的动态变化，预测细胞的未来状态，进而揭示细胞的转录动态和发育过程。这项技术通过测量RNA的"...

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数据挖掘

发表了文章 2025-05-092025-05-09 08:02:15

单细胞RNA速率(velocyto)分析学习(一)

该部分内容仅为从Cellranger到loom文件部分内容，使用的数据集是GSE188711。

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数据挖掘

发表了文章 2025-05-012025-05-01 01:03:59

单细胞上游分析/cellranger流程学习(三）

在上一步对数据进行Cellranger count分析之后，接下来可以简单看一下每个样本得到的结果文件和Summary内容，既往推文可见单细胞上游分析/cel...

凑齐六个字吧 2025-05-012025-05-01 01:03:59

数据挖掘

发表了文章 2025-04-292025-04-29 00:19:23

单细胞上游分析/cellranger流程学习(二）

在下载完数据之后就需要对数据进行后续的分析，既往推文可见单细胞上游分析/cellranger流程学习(一）：https://mp.weixin.qq.com/...

凑齐六个字吧 2025-04-292025-04-29 00:19:23

数据挖掘

发表了文章 2025-04-272025-04-27 15:32:27

单细胞实战之单细胞hdWGCNA分析——入门到进阶(高级篇3）

在高级篇2中回顾了用于拟时序分析的CytoTRACE2和monocle3两个工具。

凑齐六个字吧 2025-04-272025-04-27 15:32:27

数据挖掘

发表了文章 2025-04-212025-04-21 20:58:41

单细胞scRank药物反应推断工具学习

scRank是一种利用目标扰动基因调控网络(target-perturbed gene regulatory networks, tpGRN)对未处理scRNA...

凑齐六个字吧 2025-04-212025-04-21 20:58:41

数据挖掘

发表了文章 2025-04-202025-04-20 00:42:24

单细胞实战之CytoTRACE2和monocle3——入门到进阶(高级篇2）

接下来将回顾学习CytoTRACE2和monocle3两个工具，CytoTRACE2通过预测细胞发育潜能分数和分类，辅助研究者定位发育轨迹的起始点；而monoc...

凑齐六个字吧 2025-04-202025-04-20 00:42:24

数据挖掘

发表了文章 2025-04-172025-04-17 07:57:34

单细胞geneNMF分析流程学习

非负矩阵分解是一种用于分析高维数据的方法，它可以从一组非负数据向量中提取稀疏且有意义的特征。该方法非常适合分解单细胞RNA测序数据，有效地将大型的复杂矩阵(基因...

凑齐六个字吧 2025-04-172025-04-17 07:57:33

数据挖掘

发表了文章 2025-04-132025-04-13 16:35:01

单细胞实战之cellchat——入门到进阶(高级篇1）

在中级篇中已经完成了细胞亚群的细分流程，并回顾了几个重要的分析工具。接下来将进入高级篇的内容。首先将回顾最常用的细胞通讯工具之一——CellChat。在该讲中会...

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数据挖掘

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