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R数据科学整洁之道:使用 dplyr 处理关系数据

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简说基因
发布2022-11-11 16:16:48
6370
发布2022-11-11 16:16:48
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文章被收录于专栏:简说基因简说基因

忘了 vlookup 吧,我劝你用 dplyr 处理关系数据。

工作中经常有这样的需求,将两张表根据某些列合并起来。

有人喜欢用 Excel 的 vlookup 函数来处理。但对于生信人来说,这显然不够优雅,因为我们有更好的办法。

这就是 dplyr 包的 join 系列函数,主要有:

  • left_join
  • right_join
  • inner_join
  • full_join
  • semi_join
  • anti_join

加载包

代码语言:javascript
复制
library(tidyverse)
library(kableExtra)

数据

表 1

代码语言:javascript
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df1 = tibble(
  A = c('a', 'b', 'c'),
  B = c('x', 'y', 'z'),
  )

kable(df1)

A

B

a

x

b

y

c

z

表 2

代码语言:javascript
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df2 = tibble(
  A = c('a', 'b', 'd'), 
  C = c(3, 2, 1))

kable(df2)

A

C

a

3

b

2

d

1

在正式介绍连接之前,我们先讲一讲这个概念。

键:就是连接两个表所需要依赖的列。有时候,根据某一列,就可以把两个表连接起来,但也有可能需要根据几列才能完成连接。

合并连接

left_join

左连接,就是左边的表不变,将右边的表附加到左边,不保留右表中多余的观测。

代码语言:javascript
复制
left_join(df1, df2, by = 'A') %>%
  kable() %>%
  kable_styling()

A

B

C

a

x

3

b

y

2

c

z

NA

如果左表中的观测在右边的表中不存在,则合并后右表相应的位置标记为NA

right_join

右连接,就是右边的表不变,将左边的表附加到右边,不保留左表中多余的观察。

代码语言:javascript
复制
right_join(df1, df2, by = 'A') %>%
  kable() %>%
  kable_styling()

A

B

C

a

x

3

b

y

2

d

NA

1

inner_join

内连接,只保留在两个表中都存在的观测。

代码语言:javascript
复制
inner_join(df1, df2, by = 'A') %>%
  kable() %>%
  kable_styling()

A

B

C

a

x

3

b

y

2

full_join

全连接,保留在两个表中的所有观测。

代码语言:javascript
复制
full_join(df1, df2, by = 'A') %>%
  kable() %>%
  kable_styling()

A

B

C

a

x

3

b

y

2

c

z

NA

d

NA

1

筛选连接

semi_join

过滤左表,只保留那些在右表中存在的观测。

代码语言:javascript
复制
semi_join(df1, df2, by = 'A') %>%
  kable() %>%
  kable_styling()

A

B

a

x

b

y

anti_join

过滤左表,只保留那些不在右表中存在的观测。

代码语言:javascript
复制
anti_join(df1, df2, by = 'A') %>%
  kable() %>%
  kable_styling()

A

B

c

z

写在最后

本文简单介绍了 dplyr join 系列函数的功能,这些函数还有更加丰富的参数设置,可以参考 tidyverse 官方文档进一步学习。

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自微信公众号。
原始发表:2022-07-16,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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        • left_join
          • right_join
            • inner_join
              • full_join
              • 筛选连接
                • semi_join
                  • anti_join
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