MIMIC数据库就是一个可为临床研究者提供临床数据的利器。 该数据库于2003年在美国国立卫生研究院的资助下,由美国麻省理工学院计算生理学实验室、美国哈佛医学院贝斯以色列女执事医疗中心(Beth Israel Deaconess Medical Center,BIDMC)和飞利浦医疗公司共同建立。
研究者可根据一定的纳排标准筛选感兴趣患者的临床信息,利用这些信息可进行后续的数据分析然后撰写文章,通过数据收集与分析可作为发表sci论文的重要依据。另外,MIMIC是一个公开数据库,所有患者的信息都经过脱敏处理,发文不需要临床伦理审查。
以下各类疾病都有涉及:
MIMIC 数据库目前已经产生了MIMIC Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ三个版本 MIMIC数据库包含了BIDMC所有内外科ICU患者的数据,数据团队为保护患者隐私,对患者信息进行去标识化处理,向全世界的研究人员免费开放。
MIMIC Ⅲ数据库收集了BIDMC 2001年6月至2012年10月ICU收治的53423例成年患者数据和2001年至2008年收治的7870例新生儿重症患者数据。
MIMIC Ⅳ数据库在MIMIC Ⅲ的基础上做了一些改进,包括数据更新和部分表格重构,收集了 2008至2019年BIDMC收治的超过19万名患者、45万次住院记录的临床数据。数据库记录了患者的人口统计学信息、实验室检查、用药情况、生命体征、手术操作、疾病诊断、药物管理、随访生存状态等详细信息。
MIMIC Ⅳ数据库主要有三类数据:
患者入院信息, 以每次入院为单位记录, 每条记录有一个单独的hadm_id, hospital_expire_flag只当次住院是否院内死亡, 部分院内死亡患者没有deathtime, 可能是数据库本身问题
Name | datatype | Description |
---|---|---|
subject_id | INTEGER | 患者id |
hadm_id | INTEGER | 住院id |
admittime | TIMESTAMP(0) | 入院时间 |
dischtime | TIMESTAMP(0) | 出院时间 |
deathtime | TIMESTAMP(0) | 死亡时间 |
admission_type | VARCHAR(40) | 按入院紧迫性分为9种 |
admission_location | VARCHAR(60) | 入院来源 |
discharge_location | VARCHAR(60) | 出院去向 |
insurance | VARCHAR(255) | 保险 |
language | VARCHAR(10) | 语言 |
marital_status | VARCHAR(80) | 婚姻 |
ethnicity | VARCHAR(80 | 种族 |
edregtime | TIMESTAMP(0) | 进急诊时间 |
edouttime | TIMESTAMP(0) | 出急诊时间 |
hospital_expire_flag | SMALLINT | 是否在住院期间内死亡, 1 是 0 不是 |
病人定义:
date and time
后缀为date的,分辨率最低为天;后缀为timed的字段,分辨率最低为分钟。
分为六个模块,Core、Hosp、ICU、ED、CXR、Note
Core模块包含患者跟踪数据。这里描述了人口统计、入院信息和住院病房转院情况
admission 患者入院信息,以每次入院为单位记录,每条记录有一个单独的hadm_id
patient 患者信息
transfers 病房转移信息
Hosp模块涵盖的信息包括实验室测量,微生物学,药物管理,和收费诊断等
d_icd_diagnoses表
icd_code一定要读取为字符串,因为开头为0是有意义的,若读取为数值会有重复
包含从ICU内使用的临床信息系统收集的信息。记录在案的数据包括静脉给药、呼吸机设置和其他图表项目等。 每个患者每次入院可能有多次icu,每次icu对应一个stay_id
急诊信息,包含急诊诊断,病人体征等信息。通过subject_id和hadm_id与其他模块相连接。急诊的患者如有hadm_id,则说明该患者住院治疗。ed患者不一定住院,住院的患者也不一定从急诊入院。
X光胸片文件,源数据是dicom格式,但也提供了jpg格式的下载。包含了胸片及影像学报告。值得注意的是,存在有影像的患者没有住院记录的情况。
官方还未发布 (NOT PUBLICLY AVAILABLE): 所有文本报告,出院、超声、心电、影像等报告
原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。
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