腾讯云
开发者社区
文档
建议反馈
控制台
登录/注册
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
最新优惠活动
文章/答案/技术大牛
搜索
搜索
关闭
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,
尽在小程序
立即前往
文章
问答
(9999+)
视频
沙龙
1
回答
将cat输出到不同的文件中,并在数组中指定名称
、
、
我想对几个文件执行cat操作,这些文件的名称存储在数组中:在这里,数组的内容:1.
blastp
2.
blastp
3.
blastp
4.
blastp
5.
blastp
6.
blastp
7.
blastp
8.
blastp
9.
blastp
10.
blastp
11.
blastp</em
浏览 3
提问于2020-03-29
得票数 0
回答已采纳
1
回答
如果下一行包含
、
我正在使用
Linux
。任何使用awk或sed的命令都将不胜感激。#
BLASTP
2.2.31+# Fields: query id, subject id, evalue, % identity, % query coverage per subject#
BLASTP
# Fields: query id, subject id,
浏览 0
提问于2017-05-17
得票数 1
1
回答
使用python运行‘
blastp
时,无法将’'
blastp
‘识别为内部或外部命令错误
、
、
、
tests\fastas\my_example2.faa"stdout, stderr =
blastp
_cline() 我收到一个错误,指出: ApplicationError: Non-z
浏览 35
提问于2020-07-21
得票数 0
回答已采纳
1
回答
如何使用windows在php上运行blast?
、
、
、
这是我的代码:$cmd = "
blastp
-query -test_query.fa -dbnotas.fa -task
blastp
-outfmt '.当我运行这段代码时,我收到了以下消息: “
Blastp
”不被识别为内部或外部命令、可操作的程序或批处理文件。
浏览 4
提问于2016-07-07
得票数 0
回答已采纳
2
回答
NCBIblastPcommandline错误
、
、
、
、
我收到的完整错误是: ApplicationError: Non-zero return code 127 from '
blastp
-out blastout.tsv -outfmt 6 -queryminifasta.fasta -db uniprot_database -evalue 1e-10', message '/bin/sh:
blastp
: command not found'.
浏览 1
提问于2018-04-27
得票数 1
3
回答
在使用blast + php时获得"Error:太多的位置参数(1),违规的值: qseqid“
、
、
我使用了一个php脚本,我需要使用
blastp
来恢复一些数据。当我在命令提示符下运行它时,它工作得很好。
blastp
-query test_query.fa -db notas.fa -task
blastp
-outfmt "7 qseqid qseq sseqid sseq evalue bitscore这是我的剧本:$texto = &quo
浏览 2
提问于2016-07-11
得票数 1
2
回答
Biopython NcbiblastpCommandline无法工作:“没有这样的文件或目录:‘test.xml’
from Bio.Blast.Applications import NcbiblastpCommandline
blastp
_cline= NcbiblastpCommandline(
blastp
,query="test.fasta",db='Bos_transcript_and_prot\\bos_protein.fasta',outfmt=5,eval
浏览 2
提问于2022-03-17
得票数 1
1
回答
如何在Perl中使用用户输入运行本地程序
、
我试图从用Perl编写的网页中获取用户输入,并将其发送到本地程序(
blastp
),然后显示结果。"; 现在,我做了一些研究,但我不太理解您应该如何在我试着打开一个文件,给它写信,然后把它作为输入发送到
blastp
,但是我没有成功。作为参考,这一行将生成一个成功的输出文件: kold@sazabi
浏览 3
提问于2014-05-24
得票数 0
回答已采纳
3
回答
如何使用python单击位于selenium下的输入角色作为单选按钮
、
、
、
、
1" type="radio" aria-checked="false" class="next-radio-input"></span><span class="next-radio-label">
blastp
但我想选择名为"
blastp
“的标签。在这方面请帮帮我。
浏览 0
提问于2020-07-16
得票数 0
2
回答
利用echo和system在C++中运行软件
、
、
我正在尝试运行一个名为
BLASTP
的生物程序,它接收两个字符串(代码中的fasta_GWIDD和fasta_UNIPROT )并对它们进行比较。我遇到的问题是在代码中使用echo/system。\n",fasta_name2[i],fasta_seq2[i]); system("
blastp
$UniprotVar)");错误是: sh: -c: line 0: syntax
浏览 1
提问于2014-06-03
得票数 1
1
回答
用python格式解析BLAST.xml需要小写字符串
、
、
fasta_fileresult = NCBIWWW.qblast ("
blastp
(result.read()) result.close()pri
浏览 0
提问于2018-01-05
得票数 1
回答已采纳
1
回答
来自gridExtras的grid.arrange在更新后退出,并显示“在‘gList’中只允许'grobs‘”
、
我使用的代码是: P2=draw.pairwise.venn(3,242,3,category = c("
blastp
rep(0.5, 2), cat.pos = c(0,0),cat
浏览 1
提问于2017-04-27
得票数 2
1
回答
使用多线程在R中运行shell脚本
、
、
、
、
代码是system("
blastp
-query query.fasta -db db.fasta -num_threads 16 -outfmt \"6 qseqid sseqid pident ppos
浏览 1
提问于2017-09-14
得票数 2
1
回答
忽略N个匹配后的sed或awk替换
、
、
、
每行发生两次
blastp
-q specie.pep -db pep6 -max 1 -o 6 > specie.p.outfmt6
blastp
num 6 -max 1 -o 6 > specie.p.outfmt6blastx -q dog.fa -db p
浏览 3
提问于2016-09-22
得票数 0
回答已采纳
1
回答
HTTP 400坏请求
、
、
这是正在讨论的消息(对换行符使用\n ):HOST:UserAgent;$ua = LWP::UserAgent->new; $args = "CMD=Put&PROGRAM=
blastp
CMD=Put&PROGRAM=
blastp
&DAT
浏览 2
提问于2016-03-16
得票数 1
回答已采纳
1
回答
使用C#进程运行可执行程序
、
、
如果我键入我的命令,即:它工作得很好。但是当我从记事本复制粘贴命令时,它会给出一个错误。Program.NCBIBlastDirectory; proc.StartInfo.Arguments = "
blastp
-qu
浏览 0
提问于2011-11-11
得票数 2
回答已采纳
4
回答
本地BLAST Swissprot数据库错误
、
我正尝试在我的机器(Mac)上运行独立的ncbi-blast-2.2.28+,但在运行SwissProt数据库的
blastp
时收到以下错误信息:swissprot.08.palswissprot.10.pal然后,当我从任何工作目录(我的查询文件所在的目录)运行
blastp
时,使用以下命令:我得到以下错误消息: BLAST
浏览 1
提问于2013-06-30
得票数 0
1
回答
读取蛋白质fasta文件并在Arginine(R)上拆分读取的字符串,然后炸掉这些肽以获得匹配项?
、
、
、
、
从
blastp
获取结果,并将
blastp
结果存储在fasta文件中每个蛋白质ID的单独文件中。我对使用什么语言并不挑剔。我想学习如何做到这一点,这样我就可以在它上面构建更多的功能。谢谢!
浏览 1
提问于2013-06-08
得票数 1
回答已采纳
1
回答
设置输出后找不到ValueError文件- Biopython
、
、
、
from Bio.Blast.Applications import NcbiblastpCommandline
blastp
_cline from
浏览 18
提问于2020-10-23
得票数 0
1
回答
如何从python中调用安装在
linux
上的程序?
、
astaseq = subprocess.call(["fastacmd","-i", file1, "-o",foutname])但我被抓到了,我真的搞不懂 fastacmd_
blastp
浏览 0
提问于2013-06-18
得票数 0
回答已采纳
点击加载更多
扫码
添加站长 进交流群
领取专属
10元无门槛券
手把手带您无忧上云
相关
资讯
BLAST+使用教程
为blast+加速
Linux DNS 查询剖析 Linux 中国
Manjaro Linux 22.0 发布|Linux 中国
Alpine Linux 3.18 发布|Linux 中国
热门
标签
更多标签
云服务器
ICP备案
实时音视频
对象存储
云直播
活动推荐
运营活动
广告
关闭
领券