【flowjo】流式笔记：流式也能画t-SNE图？

哦莫哦莫！！！这竟然是用flowjo画出来的，岂不是能够和单细胞图谱很好地结合互为验证~

tSNE - FlowJo Documentation: https://docs.flowjo.com/flowjo/advanced-features/dimensionality-reduction/tsne/)

FlowJo多通道tSNE降维流式分析图 - https://www.bilibili.com/opus/732115658681090169)

以小鼠骨髓为例，就能得到：

图中只显示了部分细胞亚群哦~

然后，昨晚在群里有小伙伴发现了单细胞数据密度图，⬇

这不就是流式的密度图？？

问题在于，这是咋做出来的？

所以这个图应该是基于BBrowser平台做的，https://bioturing.com/bbrowser/download （这是收费的~）

如果课题组经费充足，而单细胞分析的水平有限，推荐去看看这个平台，用户指南➡[https://talk2data.bioturing.com/document#h.i4qjc3yovdg7)

参考文献

[1] Yang B, Davis JM, Gomez TH, et al. Characteristic pancreatic and splenic immune cell infiltration patterns in mouse acute pancreatitis. Cell Biosci. 2021;11(1):28. Published 2021 Feb 2. doi:10.1186/s13578-021-00544-1

[2] Jerome AD, Sas AR, Wang Y, et al. Cytokine polarized, alternatively activated bone marrow neutrophils drive axon regeneration. Nat Immunol. 2024;25(6):957-968. doi:10.1038/s41590-024-01836-7

[3] Vanmeerbeek I, Naulaerts S, Sprooten J, et al. Targeting conserved TIM3+VISTA+ tumor-associated macrophages overcomes resistance to cancer immunotherapy. Sci Adv. 2024;10(29):eadm8660. doi:10.1126/sciadv.adm8660