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社区首页 >问答首页 >为R中的raster()设置临时导向器不工作

问为R中的raster()设置临时导向器不工作
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Stack Overflow用户

提问于 2016-08-17 13:35:33

回答 1查看 92关注 0票数 0

我有一个大型的栅格数据集，我正在尝试使用Maxent来预测栖息地的适宜性。我在速度方面遇到了问题，因此我将代码重写为基于此post的并行处理。

ncores = 4
cl = parallel::makeCluster(ncores)
doParallel::registerDoParallel(cl,ncores)
rows=1:nrow(env)
split=sort(rows%%ncores)+1
outname="envOut"
prediction = foreach(i=unique(split), .combine=c) %dopar% {
    rows_sub=rows[split==i]
    sub = raster::crop(env,raster::extent(env,min(rows_sub),max(rows_sub),1,ncol(env)))
    raster::predict(object=env, model = model1,
    filename=paste("I:/GIS/Projects/LISU/",outname,i,".tif",sep=""))
    gc()
}
stopCluster(cl)

然而，当我这样做时，使用了超过500 GB的硬盘空间，并且我无法生成输出栅格。基于这些posts，我在我的代码块之前添加了以下代码行。

rasterOptions(tmpdir="I:/GIS/tmpdir")

I驱动器是一个拥有大量空间的外部硬盘驱动器位置。然而，这个命令似乎被忽略了，因为当我重新运行并行预测时，我的硬盘又满了。有什么建议吗？

parallel-processing

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回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2016-08-17 20:34:01

在Windows中，我设置了我的环境变量TMPDIR=I:\GIS\tmpdir.

当我启动R时，输入tempdir()检索到我想要使用的临时目录的正确路径。

我仍然不确定rasterOptions(tmpdir=...)到底是做什么的。

票数 0

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/39007325

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