问绘制分位线并连接两个小提琴曲线图
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Stack Overflow用户

提问于 2020-08-20 12:23:12

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如何在Python中绘制分位线并在plotly中连接两个小提琴图？

例如，在R (https://github.com/GRousselet/rogme)中有一个库可以做到这一点。当有两个以上的组时，所提供的库不一定有效。

python

plotly

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Stack Overflow用户

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发布于 2020-08-21 22:03:32

在Plotly中，绝对没有内置的方法可以做这么具体的事情。你能做的最好的可能是画一些线，如果你需要为不同分位数的多组数据写一个函数或一些循环。

以下是我将如何开始。如果要连接分组小提琴曲线图中的相同分位数，则可以创建一个列表或数组来存储线条的所有坐标。我承认我目前所拥有的是老生常谈的，因为它依赖于Plotly中y坐标从0开始并以1递增的组。可能有一种方法可以访问分组小提琴曲线图的y坐标，我建议您查看the documentation。

如果想要添加文本框来指示分位数的值，则需要做更多的工作。

import numpy as np
import pandas as pd

import plotly.express as px
import plotly.graph_objects as go

# generate some random data that is normally distributed
np.random.seed(42)
y1 = np.random.normal(0, 1, 1000) * 1.5 + 6
y2 = np.random.normal(0, 5, 1000) + 6

# group the data together and combine into one dataframe
df1 = pd.DataFrame({'Group': 'Group1', 'Values': y1})
df2 = pd.DataFrame({'Group': 'Group2', 'Values': y2})
df_final = pd.concat([df1, df2])

fig = px.strip(df_final, x='Values', y='Group', color_discrete_sequence=['grey'])

quantiles_list = [0.05, 0.10, 0.25, 0.50, 0.75, 0.90, 0.95]

## this is a bit hacky and relies on y coordinates for groups starting from 0 and increasing by 1
y_diff = 0
## these store the coordinates in order to connect the quantile lines
lower_coordinates, upper_coordinates = [], []
for group_name in df_final.Group.unique():
    for quantile in quantiles_list:
        quantile_value = np.quantile(df_final[df_final['Group'] == group_name].Values, quantile)
        if group_name == 'Group1':
            lower_coordinates.append((quantile_value, 0.2+1*y_diff))
        if group_name == 'Group2':
            upper_coordinates.append((quantile_value, -0.2+1*y_diff))
        fig.add_shape(
                # Vertical Line for Group1
                dict(
                    type="line",
                    x0=quantile_value,
                    y0=-0.2+1*y_diff,
                    x1=quantile_value,
                    y1=0.2+1*y_diff,
                    line=dict(
                        color="black",
                        width=4
                    )
                ),
        )
    y_diff += 1

## draw connecting lines
for idx in range(len(upper_coordinates)):
    fig.add_shape(
            dict(
                type="line",
                x0=lower_coordinates[idx][0],
                y0=lower_coordinates[idx][1],
                x1=upper_coordinates[idx][0],
                y1=upper_coordinates[idx][1],
                line=dict(
                    color="chocolate",
                    width=4
                    )
                ),
    )
fig.show()