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内核是操作系统的核心,具有很多最基本功能,负责管理系统进程、内存、设备驱动程序、文件和网络系统,决定系统性能和稳定性
#质量控制:fastqc, multiqc, fastp, trimmomatic, cutadapt, trim_galore
序列行:一个字母代表一个碱基/氨基酸,为ATCGN或20种氨基酸。#N代表在测序中无法确定具体是什么碱基
-options:选项,用来对命令进行控制,也可省略 #两种格式:-h, --help
R^2越大,越接近无标度网络,选择使R^2第一次到达0.8/0.85/0.9的β值
#Fix cell sizes and save to file with correct size
获得探针ID与序列——> //读取gtf文件
数据下载(DEO、TCGA)-差异分析(芯片与转录组不相同)-WGCNA(加权共表达网络)-富集分析(ORA、GSEA)-PPI网络-预后分析(影响生存的疾病)
拼图:par里的mfrow, grid.arrange, cowplot, patchwork
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paste0(rep("x",times=3),1:3,rep("a",time=3))
利用脚本编辑器储存代码,可重复运行。可选择逐行运行或选中多行运行(“shift”)
学习笔记
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