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社区首页 >专栏 >[Genome Biology | 论文简读] 在评估单细胞RNA-seq数据聚类时考虑细胞类型层次关系

[Genome Biology | 论文简读] 在评估单细胞RNA-seq数据聚类时考虑细胞类型层次关系

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智能生信
发布于 2022-12-29 09:16:59
发布于 2022-12-29 09:16:59
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文章被收录于专栏:智能生信智能生信

简读分享 | 崔雅轩 编辑 | 陈兴民

论文题目

Accounting for cell type hierarchy in evaluating single cell RNA-seq clustering

论文摘要

细胞聚类是单细胞RNA-seq数据分析中最常见的流程之一,其中有许多专门的算法可用。对这些方法的评价忽略了一个重要的生物学特征,即细胞群的结构是分层的,这可能会导致误导性的评价结果。在论文中,作者设计了两个新的指标,考虑到细胞类型的层次结构。本文举例说明了新指标在几个真实的单细胞数据集中的应用,并表明它们提供了生物学上更可信的结果。

论文链接

https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-020-02027-x

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原始发表:2022-10-30,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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