[Genome Biology | 论文简读] 在评估单细胞RNA-seq数据聚类时考虑细胞类型层次关系

简读分享 | 崔雅轩 编辑 | 陈兴民

论文题目

Accounting for cell type hierarchy in evaluating single cell RNA-seq clustering

论文摘要

细胞聚类是单细胞RNA-seq数据分析中最常见的流程之一，其中有许多专门的算法可用。对这些方法的评价忽略了一个重要的生物学特征，即细胞群的结构是分层的，这可能会导致误导性的评价结果。在论文中，作者设计了两个新的指标，考虑到细胞类型的层次结构。本文举例说明了新指标在几个真实的单细胞数据集中的应用，并表明它们提供了生物学上更可信的结果。

论文链接

https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-020-02027-x