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问将igraph用于两个以上的列
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Stack Overflow用户

提问于 2017-01-05 06:42:42

回答 2查看 810关注 0票数 2

我有一个数据帧(Df)，如下所示。

V1 V2 V3 V4
 A B  C  D
 A G  R  T
 M A  R  H

我的要求是绘制从V1到V2再到V3再到V4的转换图。当我使用igraph命令时

g = graph.data.frame(df)

我看到列V3和V4被删除了。有没有一种方法可以构造这样的过渡图。

tree

igraph

networking

回答 2

Stack Overflow用户

发布于 2017-01-05 06:57:14

试试这个：

library(igraph)
df <- as.matrix(df)
# to transform the df to the format that igraph expects, following will suffice for your example 
df <- as.data.frame(rbind(df[,1:2], df[,2:3], df[,3:4]))
# if you want to make it generic try the following instead
# df <- as.data.frame(do.call(rbind, lapply(1:(ncol(df)-1), function(i) df[,i:(i+1)])))
g = graph.data.frame(df)
plot(g)

票数 4

Stack Overflow用户

发布于 2017-01-05 07:05:19

我们可以通过编程的方式在list中成对设置列的子集，使用rbindlist (来自data.table)绑定dataset，转换为graph data.frame和plot

library(data.table)
library(igraph)
plot(graph.data.frame(rbindlist(lapply(seq(ncol(df)-1), function(i) df[i:(i+1)]))))

票数 2

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/41478736

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