用R的池包重新连接到PostgreSQL数据库
提问于 2019-03-04 10:00:12
我有一个用R 水管工构建的API，它使用RPostgreSQL和池子连接到PostgreSQL数据库(尽管如果我使用的是一个闪亮的应用程序，这也适用)：
# create the connection pool
pool <- dbPool(
drv = PostgreSQL(),
host = Sys.getenv("DB_HOST"),
port = 5432,
dbname = "db",
user = Sys.getenv("DB_USER"),
password = Sys.getenv("DB_PASSWORD")
)
# start the API
pr <- plumb("plumber.R")
# on stop, close the pool
pr$registerHooks(
list("exit" = function() { poolClose(pool) })
)我想每天导入新的数据。最简单的方法是创建一个新的数据库并将其推广到生产中：
CREATE DATABASE db_new;
-- create the tables
-- bulk-insert the data
SELECT pg_terminate_backend (pid) FROM pg_stat_activity WHERE datname = 'db';
DROP DATABASE db;
ALTER DATABASE db_new RENAME TO db;这是快速和最小化的停机时间。问题是，pool随后丢失的是到数据库的连接，并且不会自动尝试重新连接：
> tbl(pool, "users")
Error in postgresqlExecStatement(conn, statement, ...) :
RS-DBI driver: (could not Retrieve the result : FATAL: terminating connection due to administrator command
server closed the connection unexpectedly
This probably means the server terminated abnormally
before or while processing the request.
)即使我没有每天更换数据库，DB服务器偶尔也会重新启动，这也会导致我的应用程序崩溃。重新连接似乎不是池、RPostgreSQL或DBI的特性。有人知道解决这个问题的方法吗？
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2020-01-31 23:00:04
我使用带有以下函数的普通DBI (没有池)始终为DBI调用提供活动连接(例如DBI::dbExistsTable(rdsConnect()，"mytable"))。
#' Connect returns a database connection.
#' Retrieves the connection parameters from configuration.
#'
#' FIXME: dbIsValid is not implemented
#' https://github.com/tomoakin/RPostgreSQL/issues/76
#' workaround implemented with isPostgresqlIdCurrent()
#' @return rds allocated connection
rdsConnect <- function() {
if (!((exists("rds") && (isPostgresqlIdCurrent(rds))))) {
source('./config.R', local = TRUE)
print("New PostgreSQL connection")
rds <<- DBI::dbConnect(RPostgreSQL::PostgreSQL(),
dbname = rds_params("rds_database"),
host = rds_params("rds_host"),
user = rds_params("rds_user"),
password = rds_params("rds_password")
)
} else print("Valid PostgreSQL connection")
return(rds)
}页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/54988978
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