三代测序说

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Nucleic Acids Res.｜华大智造联合复旦大学发布人类基因组轻量级语言模型，整合卷积层以碱基分辨率解释非编码区

Integrating convolution and self-attention improves language model of human geno...

智能生信 2022-12-292022-12-29 17:44:30

NLP 服务

全长转录组 | ONT Direct RNA测序 (DRS) 技术原理、数据分析和应用

"牛津纳米孔技术公司（Oxford Nanopore Technologies，ONT）开发的第三代测序平台是目前唯一能够直接对天然RNA链进行测序的技术平台...

三代测序说 2024-08-082024-08-08 13:37:46

生物基因

RiboFR-Seq：将16S rRNA与宏基因组连接的方法

16S rRNA扩增子分析和宏基因组测序是研究微生物群落的两种主要的独立方法。近年来，许多研究将这两种方法结合起来使用，但下游的数据分析是分开进行的，在分类和功...

Listenlii-生物信息知识分享 2020-05-312020-05-31 15:03:45

dp、ip、ld、na

2023牛津纳米孔16S测序数据新的探索

有同学和我交流离线的牛津纳米孔16S测序数据分析的问题，感慨的确这种方案还是少的，我想主要原因之前大家的印象还是相比Pacbio和短读长，成本高，准确性还是差了...

用户1075469 2023-08-262023-08-26 14:18:05

数据库、工具、工作流、软件、数据

使用纳米孔测序数据进行16S-DNA条形码研究的计算方法[综述]

3.Centrifuge和Minimap2是处理纳米孔数据的最合适工具，并且可以认为它们是当前的最佳选择;

用户1075469 2020-04-142020-04-14 17:37:25

数据分析、聚类算法

全长转录组 | PacBio 全长转录组测序的时代是否已经来了？ Kinnex full-length RNA Kit测评

记得在我去新加坡参加 Nanopore Community Meeting 2023 回来后（2023年9月31日），PacBio发布了其全套 KINNEX 产...

三代测序说 2024-04-022024-04-02 17:19:56

生物基因

全长转录组 | 三代全长转录组分析流程（PacBio & ONT ）-- Bambu

今天我们继续介绍一款使用三代全长转录本数据进行转录本注释和定量的工具 - Bambu。来自新加坡科技研究局 (A-STAR) 的Jonathan Göke（图1...

三代测序说 2024-03-132024-03-13 08:21:23

生物基因

癌症样本全转录组数据的融合基因鉴定

前几期转录组周更学习分享了lncRNA和mRNA联合分析的一般套路和鉴定新lncRNA的基本流程，接下来的两周我会带大家一起学习之前一位老师对癌症样本全转录组数...

生信菜鸟团 2023-09-092023-09-09 17:15:24

报表、日志、软件、数据、索引

全基因组 - 人类基因组变异分析（PacBio) （4）-- DeepVariant

单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism，SNP）指的是基因组中单个核苷酸腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)或鸟嘌呤...

三代测序说 2023-11-122023-11-12 20:25:37

生物基因

个人简介

三代测序建库和生物信息学分析 | 讲师
山一大青年教师一枚，从事测序工作多年，致力于三代测序技术的教育与推广！
生物基因
Binghamton University | 生物技术
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山东省 | 济南市
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