用户1075469

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发表了文章 2024-07-012024-07-01 14:26:01

普大喜奔！usearch开源+64位旧版本免费用

前段时间听说USEARCH即将开源，今天另一位小编发现GitHub上已经有开源代码了。我们随即搜索了开源版本的使用效果，发现V12版本的测试结果不尽如人意，具体...

用户1075469 2024-07-012024-07-01 14:26:01

开源、测试、工具、软件、数据

发表了文章 2024-07-012024-07-01 14:25:06

usearch教程-OTU表抽平

USEARCH 是继 Mothur 和 QIIME 之后的第三大流行扩增子分析流程，目前已被引用 20,824 次。USEARCH 由 Robert Edgar...

用户1075469 2024-07-012024-07-01 14:25:07

https、教程、软件、数据、开源

发表了文章 2024-06-182024-06-18 14:11:32

QIIME 2 2024.5 更新来啦

小编划重点：发布节奏改为每年两次！Python 3.9，去污染和分类器训练的更新，各版本的预训练的分类器下载更加方便。

用户1075469 2024-06-182024-06-18 14:11:32

可视化、数据、重构、插件、开发

发表了文章 2024-06-062024-06-06 15:31:12

小白用自己游戏本训练方言分类AI识别模型

笔记本型号是Redmi G2021，配置还凑活，5800H，16G, 3050Ti Laptop（4G VRAM)，相当一般的配置啦！不过自从英伟达更新了驱动，...

用户1075469 2024-06-062024-06-06 15:31:13

arguments、测试、模型、数据、游戏

发表了文章 2024-04-122024-04-12 14:57:14

编译|mummer2circos画环状细菌基因组圈图

mummer2circos 是一个用于绘制细菌基因组的圈图（circos 图）的工具。它基于 BLAST 或 NUCMER/PROMER 的比对结果，生成 SV...

用户1075469 2024-04-122024-04-12 14:57:14

容器、heatmap、编译、工具、镜像

发表了文章 2024-03-262024-03-26 18:26:13

脚本分享—从GeneBank数据库批量下载序列

hello，hello！小伙伴们大家好，我是小编豆豆，好久没有给大家分享使用的脚本了，最近小编在一直在忙着16s整理数据库，需要下载大量物种的16s rRNA...

用户1075469 2024-03-262024-03-26 18:26:14

file、脚本、浏览器、效率、数据库

发表了文章 2024-02-232024-02-23 16:23:11

有向后不兼容接口更改，QIIME 2 2024.2 来啦

今年 12 月，QIIME 2 团队选择放弃计划的 2023.11 版本，转而减少拉取请求的长队列并开发一些新功能。

用户1075469 2024-02-232024-02-23 16:23:11

可视化、数据、插件、管理、接口

发表了文章 2024-02-222024-02-22 15:37:06

一文读懂Prodigal教程

Prodigal[1] 由橡树岭国家实验室[2]和田纳西大学诺克斯维尔分校[3]于 2007 年在能源部联合基因组研究所[4]的主持下联合开发，是一种用于细菌和...

用户1075469 2024-02-222024-02-22 15:37:07

字符串、file、翻译、教程、数据

发表了文章 2024-01-262024-01-26 19:48:34

脚本分享—将GenBank格式的文件转换为GFF3格式

小编欢乐豆又放出一个珍藏多年的脚本，2749 行的长度，长到已经难以用 GPT 解读啦，不过用起来还是很方便的！这个 perl 脚本用于将 GenBank 格式...

用户1075469 2024-01-262024-01-26 19:48:35

正则表达式、测试、脚本、镜像、模型

发表了文章 2024-01-222024-01-22 15:10:29

脚本分享—快速统计基因组组装结果

我们小编欢乐豆有个压箱底的 perl 脚本，由于编程语言"洁癖"，想要彻底抛弃 perl 语言转向 python，于是他使用 AI 辅助下进行了转换，由于脚本相...

用户1075469 2024-01-222024-01-22 15:10:29

file、函数、脚本、命令行、统计

发表了文章 2024-01-152024-01-15 17:56:31

qiime2+lefse的n个解决方案

qiime2 有自带的差异分析工具的（composition ancom），可是，大家已经习惯了一直用的 lefse，于是，把 qiime2 的结果导出进行 l...

用户1075469 2024-01-152024-01-15 17:56:31

table、解决方案、命令行、搜索、终端

发表了文章 2024-01-022024-01-02 11:12:21

全球生物样本库荟萃分析倡议 (GBMI)+整理的一个github的repo

全球生物样本库荟萃分析倡议（GBMI）旨在创建一个框架，以启动全球生物样本库和倡议合作。这个简单框架的好处包括但不限于：

用户1075469 2024-01-022024-01-02 11:12:24

github、网站、表格、框架、统计

发表了文章 2023-12-142023-12-14 08:51:11

俄罗斯生物银行（BBRU）

最近搜索发现了个新的生物银行，分享一下，summary statistics可下载。

用户1075469 2023-12-142023-12-14 08:51:13

网站、医疗、可视化、数据、搜索

发表了文章 2023-12-142023-12-14 08:51:11

俄罗斯生物银行（BBRU）

最近搜索发现了个新的生物银行，分享一下，summary statistics可下载。

用户1075469 2023-12-142023-12-14 08:51:13

网站、医疗、可视化、数据、搜索

发表了文章 2023-11-012023-11-01 13:02:15

首个宏基因组版本--Qiime2 2023.9发布啦

计划的下一个QIIME 2版本计划于2023年2月发布（QIIME2 2023.12）。

用户1075469 2023-11-012023-11-01 13:02:18

数据分析、插件、集合、可视化、连接

发表了文章 2023-10-242023-10-24 09:12:41

国内2个Biobank，一个summary statistics可下载

提示近期正在维护，暂时没有任何内容可供查看下载了。不过，GWAS Catalog的还是可以下载的，点赞！

用户1075469 2023-10-242023-10-24 09:12:44

数据库、大数据、statistics、summary、研发

发表了文章 2023-08-262023-08-26 14:18:05

2023牛津纳米孔16S测序数据新的探索

有同学和我交流离线的牛津纳米孔16S测序数据分析的问题，感慨的确这种方案还是少的，我想主要原因之前大家的印象还是相比Pacbio和短读长，成本高，准确性还是差了...

用户1075469 2023-08-262023-08-26 14:18:05

数据库、工具、工作流、软件、数据

发表了文章 2023-08-262023-08-26 14:17:19

QIIME 2 2023.7更新

今天看到官网论坛上宣布，QIIME 2 2023.7 版本现已发布！计划的下一个QIIME 2版本计划于2023年9月发布（QIIME 2023.9），本次更新...

用户1075469 2023-08-262023-08-26 14:17:19

持续集成、插件、教程、索引、系统

发表了文章 2023-08-262023-08-26 14:16:52

Parsl-Python中的高效并行编程模块

之前从qiime2的更新介绍中了解到了这个模块，这里再详细了解一下！哪天用起来呀！

用户1075469 2023-08-262023-08-26 14:16:52

python、编程、并发、函数、教程

发表了文章 2023-08-262023-08-26 14:16:00

大更新，QIIME 2 2023.5

并行化、断点续分析、输出集合、基于阴性对照识别污染、宏基因组学工作流程(即将推出！)

用户1075469 2023-08-262023-08-26 14:16:00

缓存、对象、集合、可视化、数据

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脚本分享—从GeneBank数据库批量下载序列

有向后不兼容接口更改，QIIME 2 2024.2 来啦

一文读懂Prodigal教程

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脚本分享—快速统计基因组组装结果

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