用户1075469

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文章/答案/技术大牛

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LV1

发表了文章 21天前2025-03-31 11:19:38

测试BioMaster: AI生信分析的demo测试

从去年吴恩达说agent（智能体）将大有可为，到dify等开源智能体以及Manus（多智能体应用）的爆火，AI智能体进入多智能体时代，应用也逐渐成熟。最近对两个...

用户1075469 21天前2025-03-31 11:19:38

工作、模型、软件、硬件、测试

发表了文章 2025-02-282025-02-28 08:08:34

宏病毒组binning工具—— vRhyme教程

Hello，Hello小伙伴们大家好，好久没有给大家更新微信公众文了，最近小编在学习宏病毒组，其中一个和宏基因组类似的过程——binning，然后和宏基因组bi...

用户1075469 2025-02-282025-02-28 08:08:34

软件、算法、工具、教程、排序

发表了文章 2024-12-232024-12-23 06:41:03

GPU加速生信分析--序列比对Arioc

最近偶尔探索下GPU生信软件，虽然方兴未艾，发现多数软件已经是古董，比如GPU版本的Blast，使用CUDA7，10.1这样的版本已经是最新的，软件依赖复杂，编...

用户1075469 2024-12-232024-12-23 06:41:03

编码、编译、软件、数据、gpu

发表了文章 2024-11-252024-11-25 11:28:32

PHASTEST：噬菌体注释工具使用指南

大家好，今天我们来分享一个强大的生物信息学工具——PHASTEST，用于噬菌体注释的在线工具，它可以帮助我们快速识别和分析噬菌体基因。下面，就让我们一起探索PH...

用户1075469 2024-11-252024-11-25 11:28:32

数据、图表、数据库、编码、工具

发表了文章 2024-11-252024-11-25 11:27:45

QIIME 2 2024.10 版本发布啦！

QIIME 2 的最新版本 2024.10 已经正式发布！🚀 感谢每一位参与者的辛勤工作，让我们的微生物组分析工具更加强大！

用户1075469 2024-11-252024-11-25 11:27:45

插件、开发、可视化、数据、容器

发表了文章 2024-11-232024-11-23 07:14:48

InSilicoSeq——微生物数据测序模拟工具

hello，hello！小伙伴们大家好，我是小编豆豆，最近小编在开发宏基因组流程，很多公司和小伙伴在开发流程时候，都会花大量的时间研究脚本或者软件的参数，很少有...

用户1075469 2024-11-232024-11-23 07:14:48

软件、数据、统计、工具、模型

发表了文章 2024-11-232024-11-23 07:14:38

两个人群基因组填充参考（CHN100K和NARD）

分别是中国人群和东北亚人群的填充参考，测试了下，中国人群的参考注册还是相对友好的，没有像有些网站一样严格限制。东北亚的没有测试，两个数据库的特点都是包含了少数民...

用户1075469 2024-11-232024-11-23 07:14:38

测试、工具、数据、数据库、网站

发表了文章 2024-11-232024-11-23 07:14:32

neural-admixture：基于AI的快速基因组聚类

最近学习祖源分析方面的内容，发现已经有了GPU版的软件，可以几十倍地加快运算速度，推荐使用！小数据集的话家用显卡即可hold住，十分给力！

用户1075469 2024-11-232024-11-23 07:14:32

模型、软件、数据、神经网络、集群

发表了文章 2024-11-232024-11-23 07:12:46

iSeq：GSA-SRA-ENA-GEO-DDBJ 数据下载一网打尽

最近需要下载些公共数据，在简书上搜索到了有小伙伴介绍 iseq，测试了下效果不错，可以媲美 KingFisher，虽然还没曾正式发表（预印本），亲测效果不错，推...

用户1075469 2024-11-232024-11-23 07:12:46

数据库、geo、数据、线程、压缩

发表了文章 2024-07-012024-07-01 06:26:01

普大喜奔！usearch开源+64位旧版本免费用

前段时间听说USEARCH即将开源，今天另一位小编发现GitHub上已经有开源代码了。我们随即搜索了开源版本的使用效果，发现V12版本的测试结果不尽如人意，具体...

用户1075469 2024-07-012024-07-01 06:26:01

开源、测试、工具、软件、数据

发表了文章 2024-07-012024-07-01 06:25:06

usearch教程-OTU表抽平

USEARCH 是继 Mothur 和 QIIME 之后的第三大流行扩增子分析流程，目前已被引用 20,824 次。USEARCH 由 Robert Edgar...

用户1075469 2024-07-012024-07-01 06:25:07

https、教程、软件、数据、开源

发表了文章 2024-06-182024-06-18 06:11:32

QIIME 2 2024.5 更新来啦

小编划重点：发布节奏改为每年两次！Python 3.9，去污染和分类器训练的更新，各版本的预训练的分类器下载更加方便。

用户1075469 2024-06-182024-06-18 06:11:32

可视化、数据、重构、插件、开发

发表了文章 2024-06-062024-06-06 07:31:12

小白用自己游戏本训练方言分类AI识别模型

笔记本型号是Redmi G2021，配置还凑活，5800H，16G, 3050Ti Laptop（4G VRAM)，相当一般的配置啦！不过自从英伟达更新了驱动，...

用户1075469 2024-06-062024-06-06 07:31:13

arguments、测试、模型、数据、游戏

发表了文章 2024-04-122024-04-12 06:57:14

编译|mummer2circos画环状细菌基因组圈图

mummer2circos 是一个用于绘制细菌基因组的圈图（circos 图）的工具。它基于 BLAST 或 NUCMER/PROMER 的比对结果，生成 SV...

用户1075469 2024-04-122024-04-12 06:57:14

容器、heatmap、编译、工具、镜像

发表了文章 2024-03-262024-03-26 10:26:13

脚本分享—从GeneBank数据库批量下载序列

hello，hello！小伙伴们大家好，我是小编豆豆，好久没有给大家分享使用的脚本了，最近小编在一直在忙着16s整理数据库，需要下载大量物种的16s rRNA...

用户1075469 2024-03-262024-03-26 10:26:14

file、脚本、浏览器、效率、数据库

发表了文章 2024-02-232024-02-23 08:23:11

有向后不兼容接口更改，QIIME 2 2024.2 来啦

今年 12 月，QIIME 2 团队选择放弃计划的 2023.11 版本，转而减少拉取请求的长队列并开发一些新功能。

用户1075469 2024-02-232024-02-23 08:23:11

可视化、数据、插件、管理、接口

发表了文章 2024-02-222024-02-22 07:37:06

一文读懂Prodigal教程

Prodigal[1] 由橡树岭国家实验室[2]和田纳西大学诺克斯维尔分校[3]于 2007 年在能源部联合基因组研究所[4]的主持下联合开发，是一种用于细菌和...

用户1075469 2024-02-222024-02-22 07:37:07

字符串、file、翻译、教程、数据

发表了文章 2024-01-262024-01-26 11:48:34

脚本分享—将GenBank格式的文件转换为GFF3格式

小编欢乐豆又放出一个珍藏多年的脚本，2749 行的长度，长到已经难以用 GPT 解读啦，不过用起来还是很方便的！这个 perl 脚本用于将 GenBank 格式...

用户1075469 2024-01-262024-01-26 11:48:35

正则表达式、测试、脚本、镜像、模型

发表了文章 2024-01-222024-01-22 07:10:29

脚本分享—快速统计基因组组装结果

我们小编欢乐豆有个压箱底的 perl 脚本，由于编程语言"洁癖"，想要彻底抛弃 perl 语言转向 python，于是他使用 AI 辅助下进行了转换，由于脚本相...

用户1075469 2024-01-222024-01-22 07:10:29

file、函数、脚本、命令行、统计

发表了文章 2024-01-152024-01-15 09:56:31

qiime2+lefse的n个解决方案

qiime2 有自带的差异分析工具的（composition ancom），可是，大家已经习惯了一直用的 lefse，于是，把 qiime2 的结果导出进行 l...

用户1075469 2024-01-152024-01-15 09:56:31

table、解决方案、命令行、搜索、终端

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