- 图片说明- a,b，NT训练概述（a）及其通过微调在下游基因组预测任务中的应用（b）。通过探测进行的下游任务预测类似，但没有NT中的重新缩放权重。c，NT模...

- 图片说明- a，生成包含配对转录组和TCR信息的泛疾病CD8+ T细胞图谱所用分析工作流程的示意图概述。该图谱整合了八种主要疾病类型，包含了使用原始研究中的...

随着计算结构预测技术的发展，目前可用的蛋白质复合物结构数量将大幅增加。要从这些数据中提取有价值的发现，必须对蛋白质复合物进行比对，但这在计算上极具挑战性。Fol...

- 图片说明- a，对已发表的时间序列数据集中的小鼠骨髓来源树突状细胞进行G2G比对，这些细胞分别受到PAM（参考）或LPS（查询）刺激。- b，基于99个‘核...

近年来，自然语言处理（NLP）领域的快速发展为生物信息学带来了新的研究工具，尤其是大语言模型（如BERT、GPT）在蛋白质结构预测和基因调控分析中的成功应用，揭...

错误！！！ - 待补充 [ul]- In each iteration i, we aggregate a batch from K mini-batches ...

Chen, Valerie, et al. "Applying interpretable machine learning in computational ...

2024年8月9日，来自韩国首尔国立大学生物科学学院的Minkyung Baek在Nature Methods上发表文章Towards the predicti...

今天为大家介绍的是来自美国Broad研究所中Anne E. Carpenter团队的一篇论文。现代定量图像分析技术已经使高通量、高内涵成像实验成为可能。与传统高...

今天为大家介绍的是来自InstaDeep公司和英伟达公司的一篇论文。从DNA序列中预测分子表型一直是基因组学中的一个长期挑战，通常由于注释数据的有限性和在不同任...

在科研领域，常常会有某些技术因其突破性进展而成为时代的焦点，荣获2017年诺贝尔化学奖的冷冻电镜 (Cryo-EM) 正是这样的技术之一。比如，依托冷冻电镜技术...

今天为大家介绍的是来自清华大学药学院张数一团队的一篇论文。设计功能更强大的蛋白质需要深入了解序列与功能之间的关系，但这个关系空间范围庞大，难以探索。因此，通过识...

其中 ToString() 和 父级的名称 入参都相同， o.ToString() 调用的是 哪个方法？

Deep learning-based models for preimplantation mouse and human embryos based on ...

理解蛋白-配体相互作用是分子生物学和生物化学的基础。从酶催化到信号传导，这些相互作用构成了众多细胞过程的核心。对蛋白-配体相互作用的深入理解对基于结构的药物设计...

The University of Texas Southwestern Medical Center (UTSW) is an elite research ...

癌症的进展由体细胞突变和染色质重塑共同驱动，包括核苷酸变异（SNV）、体细胞拷贝数变异（CNA）和大规模结构变异等。对批量肿瘤或分离单细胞中的体细胞突变进行测序...

蛋白质作为最重要的生命构建单元之一，其序列和功能之间的映射（适应性景观，Fitness landscape）的针对性研究对于蛋白质理性设计以及工程应用都有极大的...

机器学习，尤其是深度学习的最新进展，为计算生物学中的复杂问题提供了强大的预测模型。然而，随着模型复杂性的增加，解释这些模型的行为变得尤为重要。