基本的思路是：先把otu表格宽格式转换成长格式，然后根据样本分组求和，生成一个新的列，然后用绝对丰度值除以求和列得到相对丰度，最后再转换为长格式

这里，参数：annotatePval，注意，这里的值，不是-log10转化的，而是原始的p值，比如，这里，我们想打印1e-8的snp名称，默认一个染色体只显示一...

在tidyverse中，整洁数据一般都是每一行是一个观测，每一列是一个变量，基本上所有操作都是基于整洁的数据进行的，都是对某列做什么操作。但有时候我们也需要对某...

有人喜欢用 Excel 的 vlookup 函数来处理。但对于生信人来说，这显然不够优雅，因为我们有更好的办法。

Tidyverse 是 Rstudio 公司推出的专门使用 R 进行数据分析的一整套工具集合，里面包括了readr，tidyr， dplyr，pu...

❝本节来介绍如何通过R来批量做相关性分析，将通过两个小例子来进行介绍，1个for循环与另一个tidyverse体系； 加载R包 library(tidyvers...

❝本节来介绍如何使用R语言来做数据统计分析，通过「rstati」包进行t-test，完全使用tidyverse体系进行数据清洗及可视化 ❞ 安装并加载R包 pa...

最近有老师问如何计算多个育种值的综合育种值，因为选择育种时，需要考虑多个性状，而这些性状单位不一样，怎么合并计算？

本文来自 stack overflow 上的一个帖子 base与data.table适用 SQL版 流行的dplyr 最后看看各种操作的性能吧 data...

在[[15-R编程01-基本数据类型及其操作之向量]] 中，我就已经简单的提过，可以通过unique 或duplicated 非常暴力的实现去重。

可以使用is.na() 函数对向量进行遍历，如果存在NA，则会返回TRUE，反之。

前言 这个笔记的起因是在学习DataExplorer 包的时候，发现： 这我乍一看，牛批啊。这语法还挺长见识的。 转念思考了一下🤔，其实目的也就是将数据框中的...

原文：10 Tips And Tricks For Data Scientists Vol.4[1]

ggballoonplot（气球图）可用于多分类数据的可视化展示，其中每个单元格都包含一个点，其大小反映了相应组件的相对大小。

之前写过一篇博文（汇总统计？一个函数全部搞定！），介绍R中编写一个函数，进行汇总统计。效果很不错。今天用tidyverse包实现一下，多角度尝试，然后尝试中学习...

问题：依据group分组，按照dat（日期）升序对num列数据累计求和并生成cum_num列

本文的写作由来是知识星球一个朋友对如何在 tidyverse 系列包中使用公式函数（单侧公式）不太熟悉，所以通过本文分享一下我的心得。

tidyverse中的长款数据转换函数，类比于之前的reshape2包中的melt和dcast函数