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#ggplot2

ggplot2(r包)绘制基因棒棒糖图

生信技能树

使用geom_segment添加棒棒图的棒子,geom_point添加棒棒图上面的圈圈,geom_text_repel添加对应的文字

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R tips:ggplot2进行多维原位图绘制

生信菜鸟团

R中可以使用ggplot2的geom_tile图层绘制热图,可是有的时候我们想要每一个热图格子里面可以展示多维的信息:多个基因表达量、多个组别数据等等,而不是一...

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复杂相关性散点图复现(ggplot2绘图的层层递进)

生信技能树

如果你要从ggplot2开始一步步调制成为它这样的美图,需要下很深的功夫,一张统计图就是从数据到几何对象(点、线、条形等)的图形属性(颜色、形状、大小等)的一个...

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R包版本管理利器:renv使用初探

生信菜鸟团

但是因为拷贝R包的时候,将3.5.1版本的ggplot2复制过来了,所以需要先卸载3.5.1的ggplot2,重新创建虚拟环境,然后安装3.4.4的ggplot...

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更强的可视化:最全ggplot2扩展包整理

简说基因

该网站包含了很多ggplot2扩展包实现的案例,下面介绍在该网站中使用率高的扩展包。

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探索ggplot2的无限可能:140+ggplot2扩展包让你的图表更出彩

生信菜鸟团

这个网页中居然收录了140+个ggplot2可视化扩展包,妈妈再也不用担心我的绘图问题了吧!其中不乏大家常见的如:

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R tips:使用ggplot2绘制空间坐标图

生信菜鸟团

Xenium、Visium、VisiumHD、CellDive、Akoya等空间组学数据是包含细胞的坐标信息的,这些信息可以用于绘制空间原位图。

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使用decoupleR一次性实现11种基因集的活性打分(R与Python我都要)

生信技能树

官网github链接:https://github.com/saezlab/decoupleR

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基于VlnPlot参数及ggplot2美化小提琴图

生信技能树

因为VlnPlot是一个ggplot的对象,所以可以基于ggplot2进行美化。或者提取需要的数据,使用ggplot2直接绘制小提琴图

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ggplot2热图扩展包(ggalign)的细节

生信技能树

ggalign 相对于其他扩展如 ggheatmap 的主要优势在于其与 ggplot2 语法的完全兼容性。你可以无缝使用任何 ggplot2 geoms、st...

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使用pacman包来方便快捷的批量管理各种r包

生信技能树

当时以为是很厉害了的经验,也大力宣传了,所以绝大部分小伙伴都是直接就使用了我的经验。使用传统的install.packages或者BiocManager::in...

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ggplot2优雅绘制气泡物种组成图

R语言数据分析指南

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NC图表复现-ggplot2优雅绘制冲积图

R语言数据分析指南

Eco-evolutionary strategies for relieving carbon limitation under salt stress di...

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ggplot2绘制热图新花样

R语言数据分析指南

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ggplot2优雅绘制极坐标组合饼图

R语言数据分析指南

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ggplot2优雅绘制相关性网络热图(批量修改字符)

R语言数据分析指南

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ggplot2优雅绘制whittaker生物群系图

R语言数据分析指南

https://rawgit.com/valentinitnelav/plotbiomes/master/html/Whittaker_biomes_examp...

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用R语言的ggplot2包复现一下Nature正刊论文中的气泡图

用户7010445

linkET 这个R包里有一个函数 geom_curve2() 可以将 curvature 放到aes()里的,但是遇到一个问题,正常一个R包里的函数运行命令,...

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ggplot2优雅的进行批量绘图-多版本代码

R语言数据分析指南

2024更新的绘图内容同时包含数据+代码+markdown注释文档+文档清单,「小编只分享案例文档不额外回答问题无答疑问。」

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跟着NC学绘图-ggplot2批量绘制配对箱线图

R语言数据分析指南

注:此论文提供原始数据及绘图代码,但在运行作者代码时遇到报错颇多,小编根据作者代码进行了修改,对源代码感兴趣的可以去论文中下载。

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