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#plot

听说infercnv不更新了?好在还能用!

KS科研分享与服务-TS的美梦

听说infercnv不更新了,所以上一期介绍了一款新的CNV分析工具(听名字就很快的单细胞CNV分析之fastCNV(谢绝运行时间焦虑))。infercnv是非...

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《信号与系统》- 第四章 傅里叶变换和系统的频域分析

啊阿狸不会拉杆

        正交函数集是指一组函数,其中任意两个不同函数的内积为零,而每个函数与自身的内积不为零。在信号处理中,正交函数集常用于信号的表示和分解。

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《信号与系统》第一章 信号与系统

啊阿狸不会拉杆

        信号与系统是研究信号在系统中传输与处理的基本理论,广泛应用于通信、控制、信号处理等领域。本章将介绍信号与系统的基本概念、分类、运算及系统特性分析...

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五杆机构(Five-bar linkage)-两个圆的交点问题

懒洋洋

五连杆机构(five-bar linkage)属于平面闭环机构的典型代表,是经典连杆机构的一种,发展历史可以追溯到19世纪中后期的机构学兴起阶段。

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【生信分析】免疫组库基础分析3-基于V/D/J使用频率的聚类分析

三兔测序学社

当我们试图分析样本的整体V、D、J的使用频率与样本的其他特征如(组别,性别、治疗前后、疾病活动度等其他临床特征)是否具有相关性。我们需要对样本进行聚类分析...

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【生信分析】免疫组库基础分析3-基于V/D/J使用频率的聚类分析

三兔测序学社

当我们试图分析样本的整体V、D、J的使用频率与样本的其他特征如(组别,性别、治疗前后、疾病活动度等其他临床特征)是否具有相关性。我们需要对样本进行聚类分析...

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高分杂志Figure1绘制:PCA + 火山图 + 通路富集气泡图(包含分析代码与绘图统统给你)

生信技能树

使用 scatterplot3d 函数绘制,并保存出去。这里的图片没有办法加上像文献中一样的阴影区域,后面可以使用pdf文件用AI打开,然后添加上去:

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空间转录组学: 全局异常值检测

数据科学工厂

我们还可以借助 violin plot 来展示 QC 指标的分布,并把异常值标注出来,以此判断所选阈值是否合适,或是否排除了过多的 spot。

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【hdu】1241-Oil Deposits(DFS)(水)

FishWang

Oil Deposits Crawling in process... Crawling failed Time Limit:1000MS M...

22010

🤩 granulator | 快速运行多种反卷积方法计算细胞比例!~

生信漫卷

我们通过使用plot_similarity()计算它们的Kendall Rank相关系数来绘制所有参考谱的细胞类型相似性矩阵.

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[python]prophet运行报错NameError: name ‘go‘ is not defined

云未归来

最近在学习fbprophet时,按照安装步骤,搭建好环境之后,使用官方教程进行学习。在执行到下面这句时报错

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[python]librosa安装后测试代码plot_display

云未归来

librosa/docs/examples/plot_display.py at main · librosa/librosa · GitHub

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Nature | 5月14日发表:空间转录组文章复现(四)

天意生信云

在前三篇文章中,我们按照文章的结果顺序依次复现了Figure1、Figure2、Figure3。Figure1构建了人类胎儿大脑皮层的空间图谱,并构建了三个层级...

24310

海涅定理(Heine 定理)

云深无际

海涅定理(Heine 定理)是实分析中连接函数极限与数列极限的重要桥梁。它的核心思想是:

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Nature | 5月14日新发表:空间转录组文章复现(二)

天意生信云

今天我们接着复现文章上周分享的文章《Spatial transcriptomics reveals human cortical layer and area ...

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🤩 miRTalk | 单细胞miRNA推断及细胞间通讯!~

生信漫卷

3️⃣ 第三部分是可视化miRNA介导的细胞间通讯网络和miRNA-靶点相互作用网络。

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新版 CellphoneDB v5 新增功能:ktplots绘图包尝鲜

生信技能树

老习惯,CellphoneDB 的官网给到你:https://cellphonedb.readthedocs.io/en/latest/

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🤩 enrichment_all | 一键完成富集分析!~(配高颜值可视化!)

生信漫卷

最近做这些富集分析实在太烦了,我就自己写了2个函数,run_enrichment_all()和plot_enrichment_all()。😂

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R tips:解决monocle的plot_genes_branched_heatmap函数报错

生信菜鸟团

最近在使用monocle的plot_genes_branched_heatmap函数进行BEAM分支热图绘制时发生了一个报错,如下:

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顶刊杂志Nat Med.(IF=58.7)同款GSVA打分结果可视化

生信技能树

这个打分的双向条形图我印象中最深的是他出现在2018年8月24发表在顶刊杂志Nat Med.(IF=58.7)中,文献的标题为《Phenotype moldin...

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